46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0056 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0056  aconitase subunit 1  100 
 
 
394 aa  818    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00973129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0511  protein of unknown function DUF521  55.41 
 
 
387 aa  451  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2138  hypothetical protein  56.19 
 
 
386 aa  432  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2437  hypothetical protein  55.7 
 
 
389 aa  423  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0123  hypothetical protein  55.53 
 
 
392 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.476328  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0207  hypothetical protein  52.64 
 
 
386 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0717  aconitase subunit 1  50.37 
 
 
405 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1472  aconitase subunit 1  50 
 
 
395 aa  369  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1036  hypothetical protein  43.09 
 
 
415 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0935  hypothetical protein  45.07 
 
 
401 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196972  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0963  hypothetical protein  44.33 
 
 
401 aa  293  4e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.609642  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1010  hypothetical protein  45.75 
 
 
401 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0690809  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1745  aconitase subunit 1  45.5 
 
 
401 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0813314  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0849  protein of unknown function DUF521  41.84 
 
 
386 aa  268  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0616  predicted aconitase subunit 1  42.19 
 
 
392 aa  250  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.564704  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0796  hypothetical protein  35.55 
 
 
393 aa  231  1e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  32.78 
 
 
580 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  33.01 
 
 
580 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  30.71 
 
 
563 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6224  hypothetical protein  34.68 
 
 
428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6626  hypothetical protein  33.73 
 
 
428 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  31.54 
 
 
563 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6393  hypothetical protein  33.73 
 
 
428 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0991  hypothetical protein  30.52 
 
 
391 aa  178  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0053  hypothetical protein  31.48 
 
 
384 aa  176  8e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4969  hypothetical protein  31.73 
 
 
409 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  31.55 
 
 
580 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0008  hypothetical protein  32.04 
 
 
419 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3213  protein of unknown function DUF521  30.93 
 
 
431 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2340  aconitase subunit 1  32.28 
 
 
415 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4604  hypothetical protein  32.52 
 
 
415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3759  hypothetical protein  32.52 
 
 
415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0137498  normal  0.225559 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3764  hypothetical protein  32.52 
 
 
415 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283773  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5490  hypothetical protein  32.28 
 
 
415 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4971  hypothetical protein  31.81 
 
 
415 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901279  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3636  hypothetical protein  31.8 
 
 
415 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  28.21 
 
 
652 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  29.34 
 
 
576 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2556  hypothetical protein  32.3 
 
 
418 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000806636  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1424  aconitase subunit 1  31.46 
 
 
415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.0572647 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  28.27 
 
 
599 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1920  hypothetical protein  25.41 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0855  hypothetical protein  24.87 
 
 
373 aa  108  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1398  hypothetical protein  24.08 
 
 
380 aa  103  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.492056  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0949  aconitase subunit 1  23.9 
 
 
368 aa  102  9e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2207  hypothetical protein  27.89 
 
 
422 aa  99.4  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.352777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>