46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1010 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1010  hypothetical protein  100 
 
 
401 aa  822    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0690809  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0935  hypothetical protein  96.26 
 
 
401 aa  794    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196972  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0963  hypothetical protein  86.53 
 
 
401 aa  692    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.609642  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1745  aconitase subunit 1  96.51 
 
 
401 aa  764    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0813314  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1036  hypothetical protein  64.58 
 
 
415 aa  551  1e-155  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0616  predicted aconitase subunit 1  52.62 
 
 
392 aa  392  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.564704  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0207  hypothetical protein  48.88 
 
 
386 aa  377  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1472  aconitase subunit 1  49.01 
 
 
395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0717  aconitase subunit 1  47.51 
 
 
405 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0849  protein of unknown function DUF521  47.28 
 
 
386 aa  330  2e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2437  hypothetical protein  47.51 
 
 
389 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0511  protein of unknown function DUF521  43.95 
 
 
387 aa  318  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0123  hypothetical protein  45.3 
 
 
392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.476328  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2138  hypothetical protein  44.14 
 
 
386 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0056  aconitase subunit 1  45.75 
 
 
394 aa  280  3e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00973129 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0796  hypothetical protein  38.85 
 
 
393 aa  262  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6626  hypothetical protein  35.75 
 
 
428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6393  hypothetical protein  35.75 
 
 
428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6224  hypothetical protein  35.36 
 
 
428 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3213  protein of unknown function DUF521  35.58 
 
 
431 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0991  hypothetical protein  34.94 
 
 
391 aa  213  5.999999999999999e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4969  hypothetical protein  32.24 
 
 
409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0008  hypothetical protein  34.47 
 
 
419 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  30.43 
 
 
580 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  31.38 
 
 
580 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  29.5 
 
 
563 aa  186  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4604  hypothetical protein  32.68 
 
 
415 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3759  hypothetical protein  32.68 
 
 
415 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0137498  normal  0.225559 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  29.55 
 
 
563 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2340  aconitase subunit 1  31.71 
 
 
415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3764  hypothetical protein  32.44 
 
 
415 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283773  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5490  hypothetical protein  32.45 
 
 
415 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0053  hypothetical protein  33.33 
 
 
384 aa  177  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3636  hypothetical protein  32.21 
 
 
415 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  28.51 
 
 
652 aa  175  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4971  hypothetical protein  30.49 
 
 
415 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901279  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1424  aconitase subunit 1  31.54 
 
 
415 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.0572647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2556  hypothetical protein  32.04 
 
 
418 aa  169  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000806636  normal  0.145061 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  27.76 
 
 
576 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  29.37 
 
 
580 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0855  hypothetical protein  32.72 
 
 
373 aa  159  7e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  30.75 
 
 
599 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1398  hypothetical protein  32.71 
 
 
380 aa  152  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.492056  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1920  hypothetical protein  31.25 
 
 
373 aa  150  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0949  aconitase subunit 1  32.43 
 
 
368 aa  145  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2207  hypothetical protein  30.58 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.352777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>