46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1424 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1424  aconitase subunit 1  100 
 
 
415 aa  850    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.0572647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5490  hypothetical protein  75.42 
 
 
415 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3636  hypothetical protein  75.18 
 
 
415 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2340  aconitase subunit 1  74.46 
 
 
415 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3764  hypothetical protein  74.22 
 
 
415 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283773  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3759  hypothetical protein  74.22 
 
 
415 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0137498  normal  0.225559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4604  hypothetical protein  74.22 
 
 
415 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4971  hypothetical protein  74.22 
 
 
415 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901279  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2556  hypothetical protein  64.27 
 
 
418 aa  522  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000806636  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0008  hypothetical protein  47.24 
 
 
419 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  43.34 
 
 
580 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  40.53 
 
 
580 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  42.37 
 
 
580 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  40.48 
 
 
563 aa  272  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  39.32 
 
 
576 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  38.55 
 
 
563 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  36.7 
 
 
652 aa  239  5.999999999999999e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0796  hypothetical protein  35.01 
 
 
393 aa  203  5e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0935  hypothetical protein  31.13 
 
 
401 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196972  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1036  hypothetical protein  29.88 
 
 
415 aa  195  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0849  protein of unknown function DUF521  32.03 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0717  aconitase subunit 1  34.94 
 
 
405 aa  182  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0207  hypothetical protein  30.94 
 
 
386 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6224  hypothetical protein  29.77 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6626  hypothetical protein  29.84 
 
 
428 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6393  hypothetical protein  29.84 
 
 
428 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3213  protein of unknown function DUF521  31.29 
 
 
431 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0963  hypothetical protein  31.13 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.609642  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0511  protein of unknown function DUF521  31.86 
 
 
387 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1472  aconitase subunit 1  31.86 
 
 
395 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2437  hypothetical protein  32.35 
 
 
389 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1745  aconitase subunit 1  30.9 
 
 
401 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0813314  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1010  hypothetical protein  31.54 
 
 
401 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0690809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2138  hypothetical protein  32.37 
 
 
386 aa  164  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0123  hypothetical protein  31.13 
 
 
392 aa  156  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.476328  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0616  predicted aconitase subunit 1  32.21 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.564704  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0053  hypothetical protein  27.94 
 
 
384 aa  143  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0056  aconitase subunit 1  30.98 
 
 
394 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00973129 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2207  hypothetical protein  27.55 
 
 
422 aa  116  7.999999999999999e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.352777  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  27.11 
 
 
599 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0991  hypothetical protein  27.25 
 
 
391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4969  hypothetical protein  27.79 
 
 
409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0855  hypothetical protein  28.28 
 
 
373 aa  100  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1398  hypothetical protein  28.04 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.492056  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1920  hypothetical protein  26.36 
 
 
373 aa  92  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0949  aconitase subunit 1  26.22 
 
 
368 aa  87  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>