46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0053 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0053  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  788    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0207  hypothetical protein  33.92 
 
 
386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1036  hypothetical protein  32.37 
 
 
415 aa  196  6e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0616  predicted aconitase subunit 1  33.33 
 
 
392 aa  186  8e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.564704  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0511  protein of unknown function DUF521  30.56 
 
 
387 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0935  hypothetical protein  33.07 
 
 
401 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196972  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0963  hypothetical protein  31.36 
 
 
401 aa  171  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.609642  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0123  hypothetical protein  30.73 
 
 
392 aa  170  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.476328  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0849  protein of unknown function DUF521  33.69 
 
 
386 aa  169  8e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1745  aconitase subunit 1  31.61 
 
 
401 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0813314  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2437  hypothetical protein  31.36 
 
 
389 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1010  hypothetical protein  31.61 
 
 
401 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0690809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0717  aconitase subunit 1  30.38 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1472  aconitase subunit 1  30.48 
 
 
395 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0796  hypothetical protein  29.75 
 
 
393 aa  160  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2138  hypothetical protein  30.46 
 
 
386 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0056  aconitase subunit 1  31.09 
 
 
394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00973129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  28.18 
 
 
580 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  27.43 
 
 
580 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  28.57 
 
 
563 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  28.79 
 
 
563 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0008  hypothetical protein  28.92 
 
 
419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2556  hypothetical protein  27.67 
 
 
418 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000806636  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0991  hypothetical protein  30.1 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4971  hypothetical protein  28.43 
 
 
415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901279  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5490  hypothetical protein  27.7 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1424  aconitase subunit 1  27.14 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.0572647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  28.22 
 
 
580 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3759  hypothetical protein  26.96 
 
 
415 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0137498  normal  0.225559 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3636  hypothetical protein  27.45 
 
 
415 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4604  hypothetical protein  26.96 
 
 
415 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3764  hypothetical protein  26.72 
 
 
415 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283773  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2340  aconitase subunit 1  26.72 
 
 
415 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4969  hypothetical protein  26.11 
 
 
409 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3213  protein of unknown function DUF521  25.59 
 
 
431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  27.05 
 
 
576 aa  119  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1920  hypothetical protein  28.34 
 
 
373 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6224  hypothetical protein  26.08 
 
 
428 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6626  hypothetical protein  26.2 
 
 
428 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6393  hypothetical protein  26.2 
 
 
428 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0949  aconitase subunit 1  27.45 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  24.27 
 
 
652 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1398  hypothetical protein  27.05 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.492056  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0855  hypothetical protein  28.32 
 
 
373 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  26.19 
 
 
599 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2207  hypothetical protein  30.43 
 
 
422 aa  58.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.352777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>