40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6625 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  96.75 
 
 		 154 aa  302  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  77.94 
 
 		 150 aa  229  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  41.48 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  44.88 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  34.33 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  37.31 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  38.17 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  40 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  36.22 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  34.75 
 
 		 599 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  32.82 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  33.86 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  38.71 
 
 		 580 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  33.67 
 
 		 563 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  38.71 
 
 		 580 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  34.88 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  34.88 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  33.06 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  34.88 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0452  hypothetical protein  31.11 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.265076  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  32.56 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  39.56 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  32.63 
 
 		 563 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4968  hypothetical protein  32.81 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  30.91 
 
 		 580 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  31.91 
 
 		 576 aa  58.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  32.93 
 
 		 652 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0848  protein of unknown function DUF126  28.33 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  39.76 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  38.18 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  34.27 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  37.74 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  37.74 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  37.74 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  38.54 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  34.59 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  35.42 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>