45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0506 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  100 
 
 
130 aa  259  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  65.12 
 
 
132 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  58.91 
 
 
146 aa  163  9e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  60 
 
 
138 aa  157  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  58.59 
 
 
131 aa  153  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  55.04 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  50.38 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  49.59 
 
 
142 aa  124  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  46.4 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  47.86 
 
 
136 aa  111  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  44.44 
 
 
131 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0452  hypothetical protein  45.24 
 
 
138 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.265076  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  43.08 
 
 
130 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  43.08 
 
 
130 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  43.08 
 
 
130 aa  101  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0848  protein of unknown function DUF126  42.45 
 
 
120 aa  83.6  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  42.27 
 
 
563 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  43.01 
 
 
580 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  43.01 
 
 
580 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  32.28 
 
 
576 aa  78.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  38.78 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1865  hypothetical protein  37.5 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000298888  normal  0.822078 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  41.46 
 
 
652 aa  76.3  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1399  hypothetical protein  35.59 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.903911  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  34.92 
 
 
580 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  34.96 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  36.22 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  31.78 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  33.86 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  33.86 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  34.65 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  32 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  34.74 
 
 
563 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  36.46 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  40.66 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  31.01 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  35.42 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  35.42 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  35.42 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  37.5 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1919  hypothetical protein  29.75 
 
 
116 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  40.57 
 
 
599 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  38.46 
 
 
166 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0950  aconitase subunit 2  25.98 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4968  hypothetical protein  26.67 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>