37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1423 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  100 
 
 		 166 aa  335  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  62.22 
 
 		 149 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  64.17 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  60.74 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  64.17 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  62.41 
 
 		 152 aa  147  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  62.5 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  62.5 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  57.26 
 
 		 150 aa  118  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  46.02 
 
 		 580 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  40 
 
 		 563 aa  98.6  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  44.25 
 
 		 580 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  44.25 
 
 		 580 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  35.65 
 
 		 563 aa  85.1  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  43.62 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  38.53 
 
 		 576 aa  82.4  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  42.35 
 
 		 652 aa  82  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  38.04 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  37.63 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  38.71 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  35.83 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  37.8 
 
 		 132 aa  67.4  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  35.71 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  29.13 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  39.76 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  39.76 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  39.76 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  33.73 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  31.52 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  28.43 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  32.67 
 
 		 126 aa  45.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  32.26 
 
 		 131 aa  44.3  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1865  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000298888  normal  0.822078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0950  aconitase subunit 2  28.21 
 
 		 118 aa  41.2  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1399  hypothetical protein  31.82 
 
 		 135 aa  40.4  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.903911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>