27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0950 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0950  aconitase subunit 2  100 
 
 
118 aa  233  7e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1919  hypothetical protein  67.8 
 
 
116 aa  164  4e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1399  hypothetical protein  67.8 
 
 
135 aa  161  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.903911  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  62.71 
 
 
126 aa  156  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1865  hypothetical protein  41.28 
 
 
142 aa  87  8e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000298888  normal  0.822078 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  38.04 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0848  protein of unknown function DUF126  34.88 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  29.13 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  36.14 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  31.48 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  31.46 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  27.88 
 
 
142 aa  58.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  28.42 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  25.98 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  34.44 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  32.94 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  32.61 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  27.47 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  26.61 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  29.35 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  29.35 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  29.35 
 
 
130 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  26.19 
 
 
149 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  27.38 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  26.58 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  26.58 
 
 
159 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  26.58 
 
 
159 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>