More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3823 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3823  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 323 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750812  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3744  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4821  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05463  transcription regulator protein  47.64 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.163697 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8248  transcriptional regulator, LysR family  36.59 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0999  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 302 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0781  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0616  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1508  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2097  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0518  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.63 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1929  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2201  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 324 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253143  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5876  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 324 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5530  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2226  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2542  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  0.053524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1405  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2119  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1075  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0356329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2027  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2240  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4592  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3747  LysR, substrate-binding  32.31 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3143  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937784  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4685  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775055  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1948  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0632109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4092  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4261  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1973  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3986  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3576  carbonate dehydratase  31.06 
 
 		 309 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4759  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.983634  normal  0.183649 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2964  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3985  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2230  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 296 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4153  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 315 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4265  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 315 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.562442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2339  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1518  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2373  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01787  transcription regulator protein  33.22 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.933146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0615  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.683803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4348  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1541  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0243  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0278  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277872  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1127  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2311  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.886713 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  30.74 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4263  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 305 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05302  transcription regulator protein  36.33 
 
 		 329 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1018  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0986  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.27213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0958  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.360669  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1052  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1067  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4320  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2524  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1324  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.230209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2916  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0297  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.479957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2809  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2154  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.224535  normal  0.610808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2189  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1472  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3755  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3137  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00811136  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3472  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4053  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4613  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 296 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4313  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  30.31 
 
 		 292 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2074  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  33.45 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  33.45 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0098  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2361  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 322 aa  152  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2889  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2865  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2532  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2824  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1113  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.800719  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1852  transcriptional regulator, LysR family  31.69 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.387981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2357  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  33.9 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  0.547268 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1994  LysR family substrate binding transcriptional regulator  33.9 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2753  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2104  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>