143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3464 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3464  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  300  8.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0166666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  56.86 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27903  predicted protein  26.56 
 
 		 382 aa  58.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.411935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  52.94 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  52.94 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  52.94 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  52.94 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  52.94 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  52.94 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  52.94 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  52.94 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  52.94 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  52.94 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  52.94 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  52.94 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  52.94 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  49.02 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  49.02 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  45.1 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  45.1 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1322  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44 
 
 		 285 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45.31 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  52.94 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  52.94 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  52.94 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  47.27 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  47.27 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  47.27 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  45.1 
 
 		 254 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  45.1 
 
 		 254 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  45.1 
 
 		 254 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  45.1 
 
 		 254 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  45.1 
 
 		 254 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27775  predicted protein  27.05 
 
 		 374 aa  50.4  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00200858  normal  0.0976932 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  45.1 
 
 		 254 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  45.1 
 
 		 254 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  45.1 
 
 		 254 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  43.14 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  43.14 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  45.1 
 
 		 254 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  45.1 
 
 		 254 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  45.1 
 
 		 254 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  40 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  40.35 
 
 		 123 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  40.35 
 
 		 123 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  40.35 
 
 		 123 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  40.35 
 
 		 123 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  40.35 
 
 		 123 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1047  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1928  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.643232  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  43.14 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1494  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0162  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1755  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1777  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1004  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0627317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2552  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  44 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33352  predicted protein  23.36 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02157  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02821  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02894  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04735  hypothetical protein  42.86 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05085  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05842  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05896  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05986  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06086  hypothetical protein  42.86 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  44 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  44 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  44 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  44 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  44 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  44 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1434  hypothetical protein  40.82 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00387753  normal  0.0246951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6770  putative transposase  42.86 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0648258  normal  0.255889 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  40.82 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1032  hypothetical protein  38.78 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1512  hypothetical protein  38.78 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6488  transposase  43.14 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1488  hypothetical protein  38.78 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187879  hitchhiker  0.000281103 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01097  hypothetical protein  42.86 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  46.94 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  46.94 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  38.78 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2785  putative transposase  40.82 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1394  hypothetical protein  38.78 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.997905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  36.73 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  46 
 
 		 139 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2661  hypothetical protein  48 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0335597  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2925  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 		 269 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05998  hypothetical protein  40.82 
 
 		 128 aa  44.3  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  44 
 
 		 139 aa  43.9  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  46.94 
 
 		 135 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  42.86 
 
 		 251 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  42.86 
 
 		 251 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4653  hypothetical protein  36.73 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385837  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  42.86 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  40 
 
 		 260 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1743  hypothetical protein  36 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514492 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>