More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1170 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1170  ethanolamine utilization protein EutJ  100 
 
 		 283 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0910  ethanolamine utilization protein eutJ  75.8 
 
 		 283 aa  424  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3273  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  47.74 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3275  ethanolamine utilization protein EutJ  53.94 
 
 		 273 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1363  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  52.05 
 
 		 273 aa  249  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4899  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  48.87 
 
 		 280 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0077  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  50.81 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0363  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  51.09 
 
 		 238 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4028  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  45.79 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1946  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  49.79 
 
 		 278 aa  224  9e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1751  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  45.19 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1423  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  49 
 
 		 281 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1236  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  41.18 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2829  ethanolamine utilization protein EutJ  45.24 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2607  ethanolamine utilization protein EutJ  45.24 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2655  ethanolamine utilization protein EutJ  45.24 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2696  ethanolamine utilization protein EutJ  44.84 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2722  ethanolamine utilization protein EutJ  43.8 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.250578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02345  predicted chaperonin, ethanolamine utilization protein  42.46 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1216  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  42.46 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1223  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  42.46 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2820  ethanolamine utilization protein EutJ  42.46 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2583  ethanolamine utilization protein EutJ  42.46 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02307  hypothetical protein  42.46 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2731  ethanolamine utilization protein EutJ  42.46 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2600  ethanolamine utilization protein EutJ  42.46 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3675  ethanolamine utilization protein EutJ  42.06 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0499  ethanolamine utilization protein EutJ  43.15 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2343  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  40.96 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000945805  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  29.88 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  28.31 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  28.49 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  31.5 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2004  cell division protein FtsA  29.19 
 
 		 408 aa  59.3  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00897575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  31.36 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  31.5 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  29.69 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  31.36 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  29.7 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  27.71 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  31.25 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  30.58 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  27.2 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2556  cell division protein FtsA  32.22 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000381539  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  29.6 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  28.93 
 
 		 354 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  30.77 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  29.75 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  29.75 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  29.75 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1426  cell division protein FtsA  36.11 
 
 		 440 aa  55.8  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.365599  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1383  cell division protein FtsA  36.11 
 
 		 440 aa  55.8  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1749  cell division protein FtsA  36.11 
 
 		 440 aa  55.8  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  30.58 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  30.28 
 
 		 356 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  28.35 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  29.13 
 
 		 359 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1954  chaperone protein HscA  31.76 
 
 		 629 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.296275  normal  0.863 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0942  cell division protein FtsA  36.84 
 
 		 432 aa  54.3  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000255015  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1879  chaperone protein HscA  26.62 
 
 		 622 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  28.93 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  25.62 
 
 		 356 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2884  cell division protein  34.91 
 
 		 441 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0459922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3734  cell division protein FtsA  31.11 
 
 		 433 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000655591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3952  cell division protein FtsA  31.11 
 
 		 435 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000395844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  28.93 
 
 		 359 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  28.93 
 
 		 359 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3758  cell division protein FtsA  31.11 
 
 		 433 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000287051  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  31.43 
 
 		 361 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  28.93 
 
 		 359 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  24.88 
 
 		 372 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3960  cell division protein FtsA  31.11 
 
 		 435 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000448601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4008  cell division protein FtsA  31.11 
 
 		 435 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00060245  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4046  cell division protein FtsA  31.11 
 
 		 433 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000229317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 355 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  28.93 
 
 		 359 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  27.27 
 
 		 362 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  27.27 
 
 		 354 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  29.6 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3649  cell division protein  31.11 
 
 		 435 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3666  cell division protein  31.11 
 
 		 435 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000193108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3922  cell division protein FtsA  31.11 
 
 		 435 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000020932 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2728  chaperone protein HscA  26.26 
 
 		 622 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2651  chaperone protein HscA  26.26 
 
 		 622 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  29.6 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1233  cell division protein FtsA  31.11 
 
 		 435 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000983819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2595  chaperone protein HscA  26.26 
 
 		 622 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.899432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  28.1 
 
 		 359 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1704  chaperone protein HscA  26.26 
 
 		 622 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.366095  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3107  chaperone protein HscA  26.26 
 
 		 622 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594657  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0179  heat shock protein 70  31.97 
 
 		 571 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.633289  normal  0.123381 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1485  chaperone protein HscA  26.26 
 
 		 622 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2213  chaperone protein HscA  26.26 
 
 		 622 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2846  cell division protein FtsA  49.12 
 
 		 443 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67917  hitchhiker  0.00813822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  26.63 
 
 		 360 aa  52.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0804  Fe-S protein assembly chaperone HscA  25.18 
 
 		 622 aa  52.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.428496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1406  chaperone protein DnaK  27.87 
 
 		 642 aa  52.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.343406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  31.73 
 
 		 354 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2801  cell division protein FtsA  25.7 
 
 		 703 aa  52.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0480  heat shock protein 70  25.97 
 
 		 634 aa  52.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.742328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>