More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4028 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4028  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  100 
 
 		 283 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3275  ethanolamine utilization protein EutJ  49.08 
 
 		 273 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3273  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  46.27 
 
 		 280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0910  ethanolamine utilization protein eutJ  50.81 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1363  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  48.33 
 
 		 273 aa  235  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4899  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  46.9 
 
 		 280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1170  ethanolamine utilization protein EutJ  45.79 
 
 		 283 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1946  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  47.33 
 
 		 278 aa  227  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0363  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  48.92 
 
 		 238 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1423  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  48.05 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0077  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  48.77 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1751  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  43.33 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1236  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  42.45 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02345  predicted chaperonin, ethanolamine utilization protein  42.08 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1223  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  42.08 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02307  hypothetical protein  42.08 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2583  ethanolamine utilization protein EutJ  42.08 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1216  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  42.08 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2820  ethanolamine utilization protein EutJ  42.08 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2731  ethanolamine utilization protein EutJ  41.67 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3675  ethanolamine utilization protein EutJ  42.08 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2600  ethanolamine utilization protein EutJ  42.08 
 
 		 278 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2696  ethanolamine utilization protein EutJ  40.89 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2607  ethanolamine utilization protein EutJ  40.89 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2655  ethanolamine utilization protein EutJ  40.89 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.171806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2829  ethanolamine utilization protein EutJ  40.89 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2722  ethanolamine utilization protein EutJ  40.89 
 
 		 279 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.250578 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0499  ethanolamine utilization protein EutJ  41.46 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2343  ethanolamine utilization protein EutJ family protein  39.29 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000945805  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1668  cell division protein FtsA  31.36 
 
 		 413 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  33.33 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1919  cell division protein FtsA  28.99 
 
 		 695 aa  63.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0693277  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2009  cell division protein FtsA  29.41 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0526  cell division protein FtsA  34.64 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1886  cell division protein FtsA  27.4 
 
 		 708 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2004  cell division protein FtsA  34.69 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00897575  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1068  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  23.46 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  28.9 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  35.11 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  32.5 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  27.94 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0466  cell division protein FtsA  31.84 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.65625  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09120  cell division protein FtsA  26.34 
 
 		 421 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000811489  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0876  cell division protein FtsA  37.63 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000980071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1368  HSP70 family ATPase  27.04 
 
 		 617 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274966  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  31.03 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1813  cell division protein FtsA  25.34 
 
 		 470 aa  56.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.796315  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0027  cell division protein FtsA  25.98 
 
 		 690 aa  56.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  32.06 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  30.53 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  33.06 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  30.43 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  30.53 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  29.77 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  30.53 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0298  cell division protein FtsA  27.19 
 
 		 698 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0061  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  33.33 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  30.53 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  28.5 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  31.47 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_002978  WD1258  rod shape-determining protein MreB  28.47 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2669  cell division protein FtsA  29.61 
 
 		 410 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00924647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3124  cell division protein FtsA  28.49 
 
 		 410 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.59264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  31.79 
 
 		 352 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  31.79 
 
 		 352 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0068  cell division protein FtsA  26.4 
 
 		 437 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  31.03 
 
 		 347 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  30.53 
 
 		 347 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3793  cell division protein FtsA  26.61 
 
 		 415 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000704077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  31.72 
 
 		 346 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2975  cell division protein FtsA  28.49 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.254584  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0124  cell division protein FtsA  29.05 
 
 		 411 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0427264  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  29.56 
 
 		 339 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  25.87 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  25.87 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4060  rod shape-determining protein MreB  26.15 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.203248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1088  cell division protein FtsA  27.88 
 
 		 414 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1494  cell division protein FtsA  26.44 
 
 		 664 aa  53.5  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3546  cell division protein FtsA  29.61 
 
 		 410 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2547  cell division protein FtsA  29.61 
 
 		 410 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  28.86 
 
 		 361 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3540  cell division protein FtsA  29.61 
 
 		 410 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2329  rod shape-determining protein MreB  31.47 
 
 		 345 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1326  cell division protein FtsA  29.61 
 
 		 410 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1003  rod shape-determining protein MreB  31.47 
 
 		 345 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1122  cell division protein FtsA  29.61 
 
 		 410 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3237  cell division protein FtsA  29.61 
 
 		 410 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1542  cell division protein FtsA  26.44 
 
 		 664 aa  53.5  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0467  cell division protein FtsA  29.61 
 
 		 410 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3521  cell division protein FtsA  29.61 
 
 		 410 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2698  cell division protein FtsA  28.06 
 
 		 422 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.244594  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1600  rod shape-determining protein MreB  31.47 
 
 		 345 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  33.85 
 
 		 344 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0185  cell division protein FtsA  29.05 
 
 		 409 aa  53.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000415608  normal  0.589058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2832  cell division protein FtsA  29.05 
 
 		 410 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000848153  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2840  cell division protein FtsA  29.05 
 
 		 410 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  31.3 
 
 		 346 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1634  cell division protein FtsA  31.58 
 
 		 448 aa  53.1  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.248903  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3085  cell division protein FtsA  29.05 
 
 		 410 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  31.03 
 
 		 346 aa  52.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>