More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1088 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3793  cell division protein FtsA  95.91 
 
 
415 aa  795    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000704077  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1088  cell division protein FtsA  100 
 
 
414 aa  834    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3503  cell division protein FtsA  72.22 
 
 
415 aa  624  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000300087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2858  cell division protein FtsA  69.3 
 
 
414 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000103148  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2424  cell division protein FtsA  46.17 
 
 
411 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0673361  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1601  cell division protein FtsA  44.02 
 
 
416 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4404  cell division protein FtsA  45.37 
 
 
418 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0640092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4098  cell division protein FtsA  45.37 
 
 
418 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14475  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0124  cell division protein FtsA  46.19 
 
 
411 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0427264  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0948  cell division protein FtsA  45.06 
 
 
418 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249697  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0926  cell division protein FtsA  44.23 
 
 
415 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.998938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09120  cell division protein FtsA  43.16 
 
 
421 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000811489  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0496  cell division protein FtsA  44.85 
 
 
411 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00048929  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3494  cell division protein FtsA  45.1 
 
 
409 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0808464  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4669  cell division protein FtsA  44.77 
 
 
419 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165844  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13290  cell division protein FtsA  43.49 
 
 
415 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00675344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0416  cell division protein FtsA  44.25 
 
 
411 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.840628  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3777  cell division protein FtsA  45.15 
 
 
410 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2086  cell division protein FtsA  45.68 
 
 
412 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0360839  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3833  cell division protein FtsA  45.15 
 
 
410 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3917  cell division protein FtsA  45.15 
 
 
410 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0513  cell division protein FtsA  44.85 
 
 
411 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3969  cell division protein FtsA  44.36 
 
 
411 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000373054  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3284  cell division protein FtsA  45.1 
 
 
412 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000382408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3064  cell division protein FtsA  43.77 
 
 
411 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1341  cell division protein FtsA  44.17 
 
 
443 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.722513  normal  0.0156243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4508  cell division protein FtsA  44.17 
 
 
420 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00626998  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2197  cell division protein FtsA  45.23 
 
 
409 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0229  cell division protein FtsA  44.44 
 
 
410 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.72026e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1967  cell division protein  44.44 
 
 
413 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000443484  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2188  cell division protein FtsA  44.25 
 
 
412 aa  368  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.083381  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4383  cell division protein FtsA  44.17 
 
 
420 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000385058  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002936  DET0342  cell division protein FtsA  45.69 
 
 
408 aa  363  2e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000349095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_283  cell division protein FtsA  45.93 
 
 
408 aa  363  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000752805  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0321  cell division protein FtsA  45.69 
 
 
408 aa  363  4e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000252759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0774  cell division protein FtsA  43.87 
 
 
412 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.125422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4980  cell division protein FtsA  46.28 
 
 
417 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57290  cell division protein FtsA  46.28 
 
 
417 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0587  cell division protein FtsA  44.12 
 
 
417 aa  360  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000283199  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2603  cell division protein FtsA  44.2 
 
 
409 aa  360  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0898076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2448  cell division protein FtsA  44.06 
 
 
411 aa  360  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00757496  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2832  cell division protein FtsA  46.06 
 
 
410 aa  359  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000848153  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0849  cell division protein FtsA  43.38 
 
 
410 aa  358  7e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000717091  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3237  cell division protein FtsA  45.57 
 
 
410 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2547  cell division protein FtsA  45.57 
 
 
410 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3540  cell division protein FtsA  45.57 
 
 
410 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1122  cell division protein FtsA  45.57 
 
 
410 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0492  cell division protein FtsA  45.81 
 
 
410 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000474873  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3521  cell division protein FtsA  45.57 
 
 
410 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3546  cell division protein FtsA  45.57 
 
 
410 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1117  cell division protein FtsA  43.49 
 
 
411 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000192043  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0467  cell division protein FtsA  45.81 
 
 
410 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0035462  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0467  cell division protein FtsA  45.57 
 
 
410 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1326  cell division protein FtsA  45.57 
 
 
410 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0534  cell division protein FtsA  45.57 
 
 
410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000483364  normal  0.575152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3649  cell division protein FtsA  45.57 
 
 
410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00282858  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3124  cell division protein FtsA  44.8 
 
 
410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.59264  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0081  cell division protein FtsA  45.57 
 
 
410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000240923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0563  cell division protein FtsA  45.57 
 
 
410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000205481  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3473  cell division protein FtsA  44.47 
 
 
406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000668863  normal  0.0927017 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0665  cell division protein FtsA  43.14 
 
 
411 aa  356  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000156077  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2975  cell division protein FtsA  44.8 
 
 
410 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.254584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2840  cell division protein FtsA  45.05 
 
 
410 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2669  cell division protein FtsA  45.32 
 
 
410 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00924647  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2264  cell division protein FtsA  41.23 
 
 
412 aa  354  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0392802  hitchhiker  0.00222131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3893  cell division protein FtsA  45.23 
 
 
409 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.948827  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2186  cell division protein FtsA  42.31 
 
 
423 aa  352  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0110179  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3085  cell division protein FtsA  44.8 
 
 
410 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2720  cell division protein FtsA  44.8 
 
 
410 aa  352  8e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.705635  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0745  cell division protein FtsA  46.24 
 
 
408 aa  351  1e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0195283  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0490  cell division protein FtsA  45.07 
 
 
410 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00369012  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3466  cell division protein FtsA  45.07 
 
 
410 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000117297  hitchhiker  0.00107909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0952  cell division protein FtsA  45.97 
 
 
408 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.39676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5215  cell division protein FtsA  45.13 
 
 
411 aa  350  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3423  cell division protein FtsA  43.95 
 
 
409 aa  349  4e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2196  cell division protein FtsA  44.55 
 
 
411 aa  349  5e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000929624  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2783  cell division protein FtsA  44.01 
 
 
407 aa  347  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000760847  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2698  cell division protein FtsA  44.31 
 
 
422 aa  347  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.244594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0852  cell division protein FtsA  42.01 
 
 
409 aa  347  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000127132  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0637  cell division protein FtsA  41.75 
 
 
400 aa  346  4e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000369276  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0750  cell division protein FtsA  42.65 
 
 
410 aa  346  5e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1046  cell division protein FtsA  45.43 
 
 
408 aa  344  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000515882  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0171  cell division protein FtsA  44.31 
 
 
409 aa  343  4e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000130276  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0748  cell division protein FtsA  41.67 
 
 
412 aa  342  8e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107961  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0201  cell division protein FtsA  44.53 
 
 
422 aa  340  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0380  cell division protein FtsA  44.53 
 
 
422 aa  340  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00706299  normal  0.0389324 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2663  ATP-binding cell division protein FtsA  41.23 
 
 
412 aa  339  5e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2533  ATP-binding cell division protein FtsA  41.23 
 
 
412 aa  339  5e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2856  cell division protein FtsA  44.44 
 
 
411 aa  339  5e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000501977  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0609  cell division protein FtsA  43.68 
 
 
400 aa  338  7e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0429647  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0185  cell division protein FtsA  44.31 
 
 
409 aa  338  9e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000415608  normal  0.589058 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2489  cell division protein FtsA  45.04 
 
 
412 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.391008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_577  cell division protein FtsA  41.94 
 
 
400 aa  333  4e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0606  cell division protein FtsA  42.3 
 
 
411 aa  330  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.943795  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04363  cell division protein FtsA  41.81 
 
 
411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3450  cell division protein FtsA  39.85 
 
 
411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000166188  hitchhiker  0.000034496 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0357  cell division protein FtsA  39.95 
 
 
411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000963388  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0405  cell division protein FtsA  39.36 
 
 
411 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000457966  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0404  cell division protein FtsA  39.36 
 
 
411 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000380167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3740  cell division protein FtsA  39.36 
 
 
411 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000982016  hitchhiker  0.0000000353047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>