68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2014 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2014  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  100 
 
 		 305 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.523696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1145  2-aminophenol 1,6-dioxygenase, beta subunit  75 
 
 		 304 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1146  2-aminophenol 1,6-dioxygenase, alpha subunit  28.12 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3868  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  27.55 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04228  Homoprotocatechuate dyoxygenase  25 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4582  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3704  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.17743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4888  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04194  hypothetical protein  25 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2301  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  24.38 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1167  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.58 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1213  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.58 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343521  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1062  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.58 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1178  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.58 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1198  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.58 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2013  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  22.73 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.270872  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0628  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  23.33 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1623  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  24.65 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7520  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  23.47 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1859  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.17 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3656  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.46 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4130  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.46 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3283  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  23.75 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225438  normal  0.128816 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4234  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.03 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128738  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2362  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.12 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4132  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  24.03 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0541165  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1780  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  23.33 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.112809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4371  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  23.33 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2458  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  23.62 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1645  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.12 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2267  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.85 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1137  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.85 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  22.73 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1510  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.85 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134122  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0941  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.85 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1026  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.85 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0103  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.85 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  24.76 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1732  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157568  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1629  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.75 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
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NC_007794  Saro_2607  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  26.01 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_3499  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  25.31 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242751  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_1957  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.32 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116994  normal  0.0908545 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_3169  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  26.11 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.567995  normal  1 
 
 
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CP001800  Ssol_2712  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  21.94 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10620  homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase  24.63 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0968  homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase  24.63 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1101  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  26.62 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.31891 
 
 
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NC_009485  BBta_3528  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  24.42 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0958832  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_02480  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  24.73 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384928  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_01530  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  24.73 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710053  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0449  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  26.8 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_0242  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.82 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393613  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7503  putative dioxygenase  24.6 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1686  putative dioxygenase  25.16 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0233  aromatic ring-opening dioxygenase  25.16 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329446  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0323  aromatic ring-opening dioxygenase  25.16 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  24.01 
 
 		 481 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0934  aromatic ring-opening dioxygenase  24.6 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1919  putative class III extradiol-type catecholic dioxygenase  24.6 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2031  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase(HpaD)  22.66 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412165  normal  0.21533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5827  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  22.66 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121868  normal  0.292113 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1220  aromatic ring-opening dioxygenase  24.6 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0432  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  32.32 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0103  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  21.46 
 
 		 272 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_27390  hypothetical protein  26.67 
 
 		 256 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02098  LigB family enzyme  28.73 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2294  hypothetical protein  25.2 
 
 		 463 aa  42.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
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