78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0968 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_10620  homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase  99.35 
 
 		 307 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0968  homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase  100 
 
 		 307 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3499  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  83.39 
 
 		 307 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3169  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  78.07 
 
 		 309 aa  505  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.567995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3528  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  76.97 
 
 		 305 aa  484  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0958832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5827  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  72.79 
 
 		 287 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121868  normal  0.292113 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2031  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase(HpaD)  70.67 
 
 		 287 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412165  normal  0.21533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0242  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  65.72 
 
 		 291 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0628  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  65.26 
 
 		 285 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04228  Homoprotocatechuate dyoxygenase  65.14 
 
 		 283 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04194  hypothetical protein  65.14 
 
 		 283 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4582  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  65.14 
 
 		 283 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3704  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  65.14 
 
 		 283 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.17743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4888  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  65.14 
 
 		 283 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1213  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  65.14 
 
 		 283 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343521  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1167  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  65.14 
 
 		 283 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1062  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  65.14 
 
 		 283 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1178  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  65.14 
 
 		 283 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1198  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  64.79 
 
 		 283 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1957  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  62.94 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116994  normal  0.0908545 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2362  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  62.77 
 
 		 285 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2458  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  62.41 
 
 		 285 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1645  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  62.41 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1629  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  63.83 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4371  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  62.41 
 
 		 282 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4130  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  61.7 
 
 		 282 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1780  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  61.13 
 
 		 282 aa  362  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.112809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3283  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  61.7 
 
 		 282 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225438  normal  0.128816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3656  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  61.35 
 
 		 282 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4234  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  61.7 
 
 		 282 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128738  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4132  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  61.7 
 
 		 282 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0541165  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1732  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  62.06 
 
 		 282 aa  358  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157568  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1026  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  61.7 
 
 		 282 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1510  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  61.7 
 
 		 282 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134122  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0941  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  61.7 
 
 		 282 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2267  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  61.7 
 
 		 282 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0103  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  61.7 
 
 		 282 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1137  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  61.7 
 
 		 282 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7520  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  46.5 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3868  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  49.47 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1859  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  50 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1623  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  29.5 
 
 		 269 aa  106  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7503  putative dioxygenase  29.97 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2301  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  26.24 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2607  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  30.1 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1101  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  27.69 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.31891 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1686  putative dioxygenase  25.6 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0323  aromatic ring-opening dioxygenase  25.6 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0233  aromatic ring-opening dioxygenase  25.6 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0934  aromatic ring-opening dioxygenase  25.2 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1220  aromatic ring-opening dioxygenase  25.2 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1919  putative class III extradiol-type catecholic dioxygenase  25.2 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0234  class III extradiol-type catecholic dioxygenase, putative  26.83 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1145  2-aminophenol 1,6-dioxygenase, beta subunit  24.5 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2953  catalytic LigB subunit of aromatic ring-opening dioxygenase  26.82 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.66937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  27.63 
 
 		 470 aa  57  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2014  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  24.63 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.523696 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  25.3 
 
 		 468 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0410  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  25.67 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0436  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  25.48 
 
 		 263 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387117  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  21.31 
 
 		 466 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3593  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  25.77 
 
 		 263 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.505064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2892  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  25.28 
 
 		 263 aa  45.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0478  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  25.29 
 
 		 263 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3594  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  25.65 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3607  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  25 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3618  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  25 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0432  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  24.29 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  24 
 
 		 467 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0506  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  24.9 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2599  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  24.9 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  23.01 
 
 		 468 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1146  2-aminophenol 1,6-dioxygenase, alpha subunit  21.25 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1947  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  24.63 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0976  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  24.63 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.262372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0680  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  24.63 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0500  class III extradiol-type catecholic dioxygenase family protein  24.63 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1616  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  25.62 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>