75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0628 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0628  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  100 
 
 		 285 aa  601  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4582  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  89.75 
 
 		 283 aa  548  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04228  Homoprotocatechuate dyoxygenase  89.75 
 
 		 283 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04194  hypothetical protein  89.75 
 
 		 283 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3704  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  89.75 
 
 		 283 aa  548  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.17743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4888  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  89.75 
 
 		 283 aa  548  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1167  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  89.4 
 
 		 283 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1178  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  89.4 
 
 		 283 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1198  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  89.05 
 
 		 283 aa  544  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1213  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  89.4 
 
 		 283 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343521  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1062  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  89.4 
 
 		 283 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2362  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  87.54 
 
 		 285 aa  527  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2458  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  87.19 
 
 		 285 aa  525  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1645  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  87.19 
 
 		 285 aa  523  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1732  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  66.67 
 
 		 282 aa  410  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157568  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3283  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  67.02 
 
 		 282 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225438  normal  0.128816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1957  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  66.78 
 
 		 289 aa  407  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116994  normal  0.0908545 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4132  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  67.02 
 
 		 282 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0541165  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4234  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  67.02 
 
 		 282 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128738  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1026  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  66.31 
 
 		 282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1510  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  66.31 
 
 		 282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134122  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1137  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  66.31 
 
 		 282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4371  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  67.26 
 
 		 282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0103  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  66.31 
 
 		 282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0941  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  66.31 
 
 		 282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2267  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  66.31 
 
 		 282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1780  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  66.19 
 
 		 282 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.112809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3656  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  65.84 
 
 		 282 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1629  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  65.26 
 
 		 289 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4130  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  66.19 
 
 		 282 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10620  homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase  65.26 
 
 		 307 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0968  homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase  65.26 
 
 		 307 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5827  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  64.11 
 
 		 287 aa  394  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121868  normal  0.292113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0242  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  65.97 
 
 		 291 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393613  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2031  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase(HpaD)  64.18 
 
 		 287 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412165  normal  0.21533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3528  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  64.54 
 
 		 305 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0958832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3499  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  64.18 
 
 		 307 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3169  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  64.54 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.567995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3868  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  48.07 
 
 		 283 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7520  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  47.02 
 
 		 285 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1859  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  48.06 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0233  aromatic ring-opening dioxygenase  28.46 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329446  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0323  aromatic ring-opening dioxygenase  28.46 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1686  putative dioxygenase  28.46 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2607  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  26.55 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1220  aromatic ring-opening dioxygenase  28.06 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0934  aromatic ring-opening dioxygenase  28.06 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1919  putative class III extradiol-type catecholic dioxygenase  28.06 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7503  putative dioxygenase  28.18 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1101  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  27.59 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.31891 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0234  class III extradiol-type catecholic dioxygenase, putative  26.98 
 
 		 338 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2301  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  23.51 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1623  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  25.66 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1145  2-aminophenol 1,6-dioxygenase, beta subunit  22.99 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2014  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  23.33 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.523696 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1065  hypothetical protein  26.15 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.710418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2953  catalytic LigB subunit of aromatic ring-opening dioxygenase  25 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.66937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  26.51 
 
 		 467 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  22.37 
 
 		 481 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2316  hypothetical protein  25.93 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2680  hypothetical protein  29.13 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03046  4,5-dopa dioxygenase extradiol  26.88 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  27.78 
 
 		 470 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1695  hypothetical protein  24.49 
 
 		 474 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0103  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  22.22 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2295  hypothetical protein  23.81 
 
 		 459 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  23.83 
 
 		 467 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1146  2-aminophenol 1,6-dioxygenase, alpha subunit  20.18 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0679  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  21.05 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000247428  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2634  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  25.29 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2449  hypothetical protein  22.56 
 
 		 468 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2712  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  25.37 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0359  hypothetical protein  21.74 
 
 		 466 aa  42.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000914729  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1860  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  20.49 
 
 		 273 aa  42.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201197  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0324  protocatechuate 4,5-dioxygenase subunit beta  24.05 
 
 		 281 aa  42  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0463695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>