70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0242 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0242  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  100 
 
 		 291 aa  610  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393613  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5827  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  80.84 
 
 		 287 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121868  normal  0.292113 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2031  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase(HpaD)  81.12 
 
 		 287 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412165  normal  0.21533 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1780  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  68.9 
 
 		 282 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.112809 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4130  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  68.55 
 
 		 282 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4234  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  69.15 
 
 		 282 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128738  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3499  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  67.61 
 
 		 307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4132  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  69.15 
 
 		 282 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0541165  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3283  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  69.15 
 
 		 282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225438  normal  0.128816 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4371  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  68.09 
 
 		 282 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3656  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  67.49 
 
 		 282 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3169  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  68.31 
 
 		 309 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.567995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1732  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  68.79 
 
 		 282 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157568  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1957  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  68.44 
 
 		 289 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116994  normal  0.0908545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0628  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  65.97 
 
 		 285 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10620  homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase  65.72 
 
 		 307 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1629  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  68.09 
 
 		 289 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0968  homoprotocatechuate 2,3-dioxygenase  65.72 
 
 		 307 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1026  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  67.73 
 
 		 282 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0941  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  67.73 
 
 		 282 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1510  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  67.73 
 
 		 282 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134122  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1137  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  67.73 
 
 		 282 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0103  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  67.73 
 
 		 282 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2267  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  67.73 
 
 		 282 aa  391  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1213  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  64.46 
 
 		 283 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343521  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1167  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  64.46 
 
 		 283 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1062  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  64.46 
 
 		 283 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1178  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  64.46 
 
 		 283 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3528  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  64.69 
 
 		 305 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0958832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1198  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  64.11 
 
 		 283 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.896873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4582  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  63.41 
 
 		 283 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04228  Homoprotocatechuate dyoxygenase  63.41 
 
 		 283 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04194  hypothetical protein  63.41 
 
 		 283 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3704  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  63.41 
 
 		 283 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.17743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4888  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  63.41 
 
 		 283 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2362  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  62.9 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1645  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  62.54 
 
 		 285 aa  368  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2458  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  62.77 
 
 		 285 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7520  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  45.39 
 
 		 285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3868  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD_Fe  46.48 
 
 		 283 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1859  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase  45.26 
 
 		 283 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2301  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  27.84 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1623  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  29.13 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7503  putative dioxygenase  29.67 
 
 		 307 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2607  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  26.99 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1686  putative dioxygenase  28.4 
 
 		 308 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0233  aromatic ring-opening dioxygenase  28.4 
 
 		 308 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329446  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0323  aromatic ring-opening dioxygenase  28.4 
 
 		 308 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1919  putative class III extradiol-type catecholic dioxygenase  27.98 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0934  aromatic ring-opening dioxygenase  27.98 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1220  aromatic ring-opening dioxygenase  27.98 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1101  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  28.24 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.31891 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0234  class III extradiol-type catecholic dioxygenase, putative  29.74 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0324  hypothetical protein  26.64 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1145  2-aminophenol 1,6-dioxygenase, beta subunit  24.42 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2953  catalytic LigB subunit of aromatic ring-opening dioxygenase  26.43 
 
 		 277 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.66937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2014  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  22.82 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.523696 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0337  hypothetical protein  28.52 
 
 		 470 aa  48.5  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.219744  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2964  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  24.66 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.988157  normal  0.549704 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03046  4,5-dopa dioxygenase extradiol  25.14 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0269  hypothetical protein  26.5 
 
 		 467 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2316  hypothetical protein  24.53 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1146  2-aminophenol 1,6-dioxygenase, alpha subunit  23.33 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0432  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  24.06 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17380  hypothetical protein  23.81 
 
 		 481 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2839  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  23.97 
 
 		 271 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1824  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  23.29 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.436879  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1725  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  27.08 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1616  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  26.04 
 
 		 269 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2821  extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  24.11 
 
 		 270 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>