More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3126 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3126  DnaB domain-containing protein  100 
 
 		 419 aa  867    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1377  DnaB domain protein helicase domain protein  24.45 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0470845  hitchhiker  0.00000000022728 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  25.24 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  23.27 
 
 		 525 aa  84  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  25.52 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  22.3 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  23.77 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  25.92 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  24.47 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  22.54 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  24.94 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1232  replicative DNA helicase  24.59 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.323473  normal  0.298764 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  20.89 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  25.12 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  24.23 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  23.65 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  24.54 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  24.6 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  24.7 
 
 		 476 aa  79.7  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  26.27 
 
 		 468 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  23.93 
 
 		 470 aa  79.7  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  21.99 
 
 		 454 aa  79.7  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1223  replicative DNA helicase  23.25 
 
 		 461 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  23.99 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  23.75 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  23.75 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  23.75 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  23.75 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  23.75 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  23.75 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2624  replicative DNA helicase  26.39 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  23.75 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  24.4 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  23.31 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  24.71 
 
 		 468 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  23.52 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  22.45 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  24.29 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2432  DnaB domain protein helicase domain protein  22.74 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  22.08 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  24.47 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  22.08 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  23.53 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03768  replicative DNA helicase  24.3 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000140287  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  25.41 
 
 		 449 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  22.35 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  23.89 
 
 		 460 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  23.13 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  22.25 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  22.25 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  22.25 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  22.25 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  26.52 
 
 		 844 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  22.25 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  22.25 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  22.25 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  22.31 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  24.41 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0024  replicative DNA helicase  27.04 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  23.88 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  22.25 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  20.46 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  20.92 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  24.88 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  22.25 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  24.08 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  22.04 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  24.08 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  25.12 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  23.65 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0739  replicative DNA helicase  24.05 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0535  replicative DNA helicase  21.43 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2373  replicative DNA helicase  22.25 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.547053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  24.08 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  23.85 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  23.85 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  22.46 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  22.6 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2007  replicative DNA helicase  21.88 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  23.83 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  23.87 
 
 		 471 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  24.88 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  24.65 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  24.88 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  23.42 
 
 		 470 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  23.84 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0667  replicative DNA helicase  20.69 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.486749  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  23.75 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0328  DnaB-like helicase  23.57 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0149353  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  23.02 
 
 		 470 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  22.74 
 
 		 450 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  23.75 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  23.75 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  23.33 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  23.75 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  23.75 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  21.63 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  23.33 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  23.86 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0587  replicative DNA helicase  20.69 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.198545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>