27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2824 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  37.42 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  39.24 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  40.25 
 
 		 164 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  32.92 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  34.59 
 
 		 161 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  36.94 
 
 		 151 aa  90.5  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  37.42 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  30.82 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4273  hypothetical protein  32.69 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  31.21 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  35.46 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2799  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  31.79 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  25.62 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0648  hypothetical protein  29.3 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1190  hypothetical protein  44.09 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.142007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3016  nucleic acid binding protein  30.82 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0730966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1352  hypothetical protein  34.85 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0162  hypothetical protein  27.39 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0319  hypothetical protein  30.97 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0629  hypothetical protein  35.25 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2312  hypothetical protein  27.39 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571534  decreased coverage  0.00751047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2060  hypothetical protein  43.3 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1906  hypothetical protein  26.47 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5848  hypothetical protein  26.14 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0181  hypothetical protein  31.58 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.906832  normal  0.0862091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>