29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4640 on replicon NC_013168
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  299  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  41.06 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  39.85 
 
 
153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  36.3 
 
 
154 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2799  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  38.99 
 
 
167 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  38.61 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  33.54 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  33.75 
 
 
164 aa  93.6  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  35.22 
 
 
162 aa  93.6  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  39.61 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  36.94 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  36.2 
 
 
165 aa  90.5  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0648  hypothetical protein  32.12 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  31.87 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0162  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1190  hypothetical protein  33.64 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.142007 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4273  hypothetical protein  31.41 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  31.25 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1352  hypothetical protein  35.61 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2312  hypothetical protein  40 
 
 
165 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571534  decreased coverage  0.00751047 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0319  hypothetical protein  26.97 
 
 
160 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296271  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1370  hypothetical protein  32.26 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.402677 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0629  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2060  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3151  hypothetical protein  39.62 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0318  hypothetical protein  26.95 
 
 
184 aa  44.7  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132647  normal  0.255725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0299  hypothetical protein  25.49 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.435875  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0181  hypothetical protein  27.1 
 
 
178 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.906832  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1357  hypothetical protein  26.24 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>