22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2060 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2060  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  215  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  77.45 
 
 
164 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  57.69 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  53.61 
 
 
161 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  50.51 
 
 
165 aa  96.3  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  45.74 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  47.87 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  43.27 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  43.48 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  43.3 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1190  hypothetical protein  42.68 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.142007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  39.53 
 
 
162 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  34.83 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  38.54 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  31.68 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0629  hypothetical protein  42.86 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216798 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2799  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  33.33 
 
 
167 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2312  hypothetical protein  35.05 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571534  decreased coverage  0.00751047 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5848  hypothetical protein  36.59 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0162  hypothetical protein  34.88 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0648  hypothetical protein  35.71 
 
 
162 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4273  hypothetical protein  33.72 
 
 
161 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.243537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>