25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0051 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  300  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  56.29 
 
 
153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  43.62 
 
 
154 aa  131  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  41.06 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  39.24 
 
 
159 aa  103  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  39.38 
 
 
164 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  35.8 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  36.88 
 
 
164 aa  92  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  37.11 
 
 
162 aa  87.8  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  38.16 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  34.16 
 
 
164 aa  80.1  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0648  hypothetical protein  32.48 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1190  hypothetical protein  39.62 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.142007 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0162  hypothetical protein  31.85 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2312  hypothetical protein  33.54 
 
 
165 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571534  decreased coverage  0.00751047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4273  hypothetical protein  30.13 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  32.72 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1352  hypothetical protein  38.46 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0629  hypothetical protein  34.13 
 
 
168 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2060  hypothetical protein  47.87 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2799  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  29.56 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5848  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0319  hypothetical protein  27.81 
 
 
160 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296271  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1683  PilT protein domain protein  30.48 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.767605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>