28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2350 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  317  6e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  43.75 
 
 		 162 aa  114  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  39.38 
 
 		 151 aa  97.4  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  40.25 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  40.3 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  34.78 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  38.61 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  36.48 
 
 		 162 aa  95.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  36.88 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0648  hypothetical protein  33.12 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2799  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  32.1 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  35.8 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0162  hypothetical protein  31.01 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  35.67 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0629  hypothetical protein  38.12 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.216798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  26.71 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1190  hypothetical protein  41.38 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.142007 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5848  hypothetical protein  31.71 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4273  hypothetical protein  29.03 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2312  hypothetical protein  38.4 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571534  decreased coverage  0.00751047 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1352  hypothetical protein  37.11 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2060  hypothetical protein  43.27 
 
 		 112 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0319  hypothetical protein  28.67 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0181  hypothetical protein  27.74 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.906832  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1370  hypothetical protein  33.87 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.402677 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2366  hypothetical protein  32.35 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.387018  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1906  hypothetical protein  30.66 
 
 		 170 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>