28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4045 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  315  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  36.65 
 
 
161 aa  97.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  36.48 
 
 
164 aa  95.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2799  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  33.13 
 
 
167 aa  91.3  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  36.08 
 
 
159 aa  87  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  33.73 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  32.28 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  31.21 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  33.74 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4273  hypothetical protein  29.75 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  31.25 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0648  hypothetical protein  28.86 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  32.72 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  26.28 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0162  hypothetical protein  30.46 
 
 
160 aa  61.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1352  hypothetical protein  33.71 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1190  hypothetical protein  36.36 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.142007 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1370  hypothetical protein  31.65 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.402677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2060  hypothetical protein  39.53 
 
 
112 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0629  hypothetical protein  32.58 
 
 
168 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216798 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1906  hypothetical protein  27.54 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  29.75 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2312  hypothetical protein  27.74 
 
 
165 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571534  decreased coverage  0.00751047 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2555  hypothetical protein  22.73 
 
 
169 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5848  hypothetical protein  27.63 
 
 
164 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0181  hypothetical protein  26.59 
 
 
178 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.906832  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0319  hypothetical protein  28.18 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296271  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>