23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2799 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2799  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  100 
 
 
167 aa  332  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  38.99 
 
 
151 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  35.4 
 
 
159 aa  94.7  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  32.73 
 
 
164 aa  92  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  33.13 
 
 
162 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  31.29 
 
 
161 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  33.13 
 
 
162 aa  87.8  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  32.1 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  31.48 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  31.33 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  31.79 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1352  hypothetical protein  35 
 
 
142 aa  63.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  29.56 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  26.06 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1190  hypothetical protein  30 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.142007 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0181  hypothetical protein  28.05 
 
 
178 aa  54.7  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.906832  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4273  hypothetical protein  26.92 
 
 
161 aa  54.3  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0648  hypothetical protein  27.27 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1906  hypothetical protein  25.97 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  28.31 
 
 
153 aa  50.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0162  hypothetical protein  26.67 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2555  hypothetical protein  25.97 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2060  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>