23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1011 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  304  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  56.29 
 
 
151 aa  164  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  49.63 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  39.85 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  30.82 
 
 
159 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  34.94 
 
 
165 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  34.59 
 
 
161 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  33.54 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  34.57 
 
 
164 aa  84.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  31.25 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  35.8 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  35.71 
 
 
159 aa  82  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0648  hypothetical protein  29.75 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1352  hypothetical protein  35.19 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4273  hypothetical protein  29.03 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  26.28 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0162  hypothetical protein  28.21 
 
 
160 aa  60.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2312  hypothetical protein  28.03 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571534  decreased coverage  0.00751047 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1190  hypothetical protein  31.13 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.142007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2060  hypothetical protein  43.48 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2799  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  28.31 
 
 
167 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5848  hypothetical protein  38.78 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0629  hypothetical protein  35.14 
 
 
168 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>