24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4273 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4273  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  327  4e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0648  hypothetical protein  33.12 
 
 
162 aa  89  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  32.69 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  28.66 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1352  hypothetical protein  45.35 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  29.75 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  32.45 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0162  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  31.21 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  31.41 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  30.13 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  29.03 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  26.28 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  29.2 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  29.03 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2799  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  26.92 
 
 
167 aa  54.3  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  27.67 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  31.43 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1370  hypothetical protein  25.81 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.402677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0181  hypothetical protein  25.36 
 
 
178 aa  44.7  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.906832  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2312  hypothetical protein  28.39 
 
 
165 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571534  decreased coverage  0.00751047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0629  hypothetical protein  29.49 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216798 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1906  hypothetical protein  27.04 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2060  hypothetical protein  33.72 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>