27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1354 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  323  7e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  55.21 
 
 
164 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  53.05 
 
 
165 aa  157  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  46.58 
 
 
161 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  43.75 
 
 
164 aa  114  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  33.74 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  37.5 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  35.22 
 
 
151 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2060  hypothetical protein  58.82 
 
 
112 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  38.75 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2799  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  33.13 
 
 
167 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  37.11 
 
 
151 aa  87.8  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  33.54 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1190  hypothetical protein  33.86 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.142007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2312  hypothetical protein  36.15 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571534  decreased coverage  0.00751047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4273  hypothetical protein  31.21 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0648  hypothetical protein  31.68 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  23.75 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1352  hypothetical protein  30.88 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0162  hypothetical protein  30.43 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0629  hypothetical protein  35.12 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216798 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5848  hypothetical protein  32.08 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1370  hypothetical protein  28.75 
 
 
156 aa  57.8  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.402677 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0319  hypothetical protein  27.39 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296271  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3016  nucleic acid binding protein  28.3 
 
 
173 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0730966  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02300  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  27.5 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>