28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1610 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  100 
 
 
164 aa  314  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  40 
 
 
165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  39.26 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  37.2 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  38.79 
 
 
159 aa  106  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  34.78 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  33.74 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  33.75 
 
 
151 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  32.92 
 
 
159 aa  92.8  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  36.88 
 
 
151 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2799  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  32.73 
 
 
167 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  34.57 
 
 
153 aa  84.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  32.92 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4273  hypothetical protein  28.66 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  33.74 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0648  hypothetical protein  24.84 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0319  hypothetical protein  33.73 
 
 
160 aa  60.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296271  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2312  hypothetical protein  28.3 
 
 
165 aa  60.8  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571534  decreased coverage  0.00751047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2060  hypothetical protein  45.74 
 
 
112 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0162  hypothetical protein  25 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1190  hypothetical protein  31.82 
 
 
140 aa  54.7  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.142007 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1352  hypothetical protein  36.56 
 
 
142 aa  54.3  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5848  hypothetical protein  29.94 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1906  hypothetical protein  23.93 
 
 
170 aa  51.6  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3016  nucleic acid binding protein  28.17 
 
 
173 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0730966  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0629  hypothetical protein  34.59 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0181  hypothetical protein  28.31 
 
 
178 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.906832  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2555  hypothetical protein  22.22 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>