19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1352 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1352  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  275  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4273  hypothetical protein  45.35 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  37.23 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  35.19 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2799  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  35 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  30.88 
 
 
162 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  38.46 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  34.85 
 
 
159 aa  61.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0648  hypothetical protein  40 
 
 
162 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  35.61 
 
 
151 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  30.48 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  31.39 
 
 
161 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  33.71 
 
 
162 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0162  hypothetical protein  37.89 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  30.88 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1190  hypothetical protein  35.29 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.142007 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  36.56 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  27.94 
 
 
165 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  37.11 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>