29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2614 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  49.63 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  43.62 
 
 
151 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  36.3 
 
 
151 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  32.92 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  33.55 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  32.32 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  27.04 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  25.62 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  26.38 
 
 
165 aa  70.5  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  23.75 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0648  hypothetical protein  28.85 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  26.71 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4273  hypothetical protein  26.28 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0162  hypothetical protein  28.85 
 
 
160 aa  60.5  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2312  hypothetical protein  28 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571534  decreased coverage  0.00751047 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1352  hypothetical protein  30.48 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5848  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2799  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  26.06 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1190  hypothetical protein  30.48 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.142007 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1370  hypothetical protein  29.11 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.402677 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  29.75 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2060  hypothetical protein  31.68 
 
 
112 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0319  hypothetical protein  26.67 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296271  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0299  hypothetical protein  24.68 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.435875  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0629  hypothetical protein  30.77 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216798 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3151  hypothetical protein  37.68 
 
 
176 aa  41.6  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1683  PilT protein domain protein  37.1 
 
 
168 aa  41.2  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.767605  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2724  hypothetical protein  36.36 
 
 
176 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>