29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0102 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  100 
 
 
159 aa  302  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  38.79 
 
 
164 aa  106  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  36.63 
 
 
165 aa  97.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2799  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  35.4 
 
 
167 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  40.62 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  39.61 
 
 
151 aa  90.9  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  37.42 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  38.75 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  36.08 
 
 
162 aa  87  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  38.16 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  35.71 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  33.55 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  34.15 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0648  hypothetical protein  32.92 
 
 
162 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  35.67 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4273  hypothetical protein  32.45 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.243537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1190  hypothetical protein  39.42 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.142007 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1352  hypothetical protein  37.23 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0162  hypothetical protein  31.45 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5848  hypothetical protein  34.32 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1370  hypothetical protein  31.97 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.402677 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0181  hypothetical protein  31.98 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.906832  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0319  hypothetical protein  30.25 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296271  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2366  hypothetical protein  36.27 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.387018  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2060  hypothetical protein  38.54 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0629  hypothetical protein  31.39 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2312  hypothetical protein  27.04 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571534  decreased coverage  0.00751047 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4017  hypothetical protein  29.25 
 
 
170 aa  44.7  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1906  hypothetical protein  24.36 
 
 
170 aa  40.8  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>