16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5848 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5848  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0102  nucleic acid binding protein  34.32 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  29.27 
 
 
164 aa  60.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  32.08 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0629  hypothetical protein  33.55 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  30.57 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2614  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.345507  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  31.71 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2001  hypothetical protein  39.06 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  29.94 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  38.78 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4045  hypothetical protein  27.63 
 
 
162 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.927095 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  26.14 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  26.81 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1804  hypothetical protein  31.36 
 
 
208 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970721  normal  0.496101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>