20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3016 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3016  nucleic acid binding protein  100 
 
 		 173 aa  353  8.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0730966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2824  nucleic acid-binding protein  30.82 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.301151  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0319  hypothetical protein  29.34 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3501  hypothetical protein  27.39 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1354  hypothetical protein  28.3 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000200995  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3151  hypothetical protein  29.75 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1683  PilT protein domain protein  30.18 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.767605  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1610  nucleic acid binding protein  28.17 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3295  hypothetical protein  27.39 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1906  hypothetical protein  27.92 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4030  hypothetical protein  27.33 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.317302 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4640  hypothetical protein  25.74 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1011  hypothetical protein  24.64 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0181  hypothetical protein  25.81 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.906832  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2350  hypothetical protein  32.56 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1370  hypothetical protein  29.05 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.402677 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1352  hypothetical protein  32.06 
 
 		 142 aa  42  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2799  nucleic acid-binding protein contains PIN domain-like protein  23.23 
 
 		 167 aa  42  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2312  hypothetical protein  29.61 
 
 		 165 aa  40.8  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571534  decreased coverage  0.00751047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0051  hypothetical protein  26.62 
 
 		 151 aa  40.8  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0978625  normal  0.136632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>