88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0396 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 222 aa  457  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  61.76 
 
 		 271 aa  332  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  68.47 
 
 		 222 aa  323  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  66.96 
 
 		 224 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  61.88 
 
 		 223 aa  279  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  61.88 
 
 		 223 aa  279  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  63.27 
 
 		 224 aa  278  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  62.05 
 
 		 224 aa  275  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  59.91 
 
 		 227 aa  268  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  41.92 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  41.92 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  43.1 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  42.67 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  42.67 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.48 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  41.48 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  41.05 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  39.38 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  41.05 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  41.05 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  34.35 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.17 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  38.94 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.96 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  34.47 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.05 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  31.67 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  34.04 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  36.52 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 		 236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  32.92 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  33.2 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  33.61 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  33.04 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  32.57 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  29.96 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  32.89 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  32.89 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  32.89 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  32.89 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  32.89 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  34.93 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  29.55 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  28.7 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  26.81 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  29.71 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  25.74 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  25.99 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  28.84 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  27.07 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  26.73 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  25.81 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 401 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.57 
 
 		 369 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  35.14 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  25.56 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  26.44 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  27.06 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  27.08 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  26.06 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.65 
 
 		 158 aa  43.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  34.09 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  26.87 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  24.66 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  26.82 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  24.88 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  34.74 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  26.56 
 
 		 223 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  25 
 
 		 247 aa  41.6  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  25.69 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  25.33 
 
 		 249 aa  41.6  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2228  phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 		 227 aa  41.6  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>