82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_27570 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  100 
 
 
238 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  60.43 
 
 
236 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  60.43 
 
 
236 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  58.72 
 
 
232 aa  279  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  57.87 
 
 
236 aa  278  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  54.89 
 
 
236 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  55.32 
 
 
236 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  54.47 
 
 
288 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  54.04 
 
 
236 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  54.04 
 
 
236 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  53.62 
 
 
236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 
230 aa  151  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  34.75 
 
 
236 aa  141  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 
234 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  34.33 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  34.05 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  34.05 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  34.05 
 
 
229 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  34.05 
 
 
229 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  34.05 
 
 
229 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  34.05 
 
 
229 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  34.05 
 
 
229 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  34.89 
 
 
229 aa  125  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 
224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 
236 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  34.47 
 
 
236 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
224 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.92 
 
 
224 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
224 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 
224 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.44 
 
 
224 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.74 
 
 
222 aa  108  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 
225 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 
222 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  31.3 
 
 
235 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 
225 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  31.42 
 
 
223 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  31.42 
 
 
223 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  28.45 
 
 
244 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 
224 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  29.36 
 
 
227 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 
234 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  30.38 
 
 
220 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  31.65 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  29.96 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  25.94 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
210 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  26.05 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  26.36 
 
 
209 aa  53.1  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  27.08 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  26.86 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  25.74 
 
 
220 aa  48.9  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  25.93 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1985  phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  23.71 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  26.05 
 
 
207 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 
196 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  31.65 
 
 
250 aa  42  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 
203 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  30.86 
 
 
250 aa  42  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2594  phosphoglycerate mutase  26.55 
 
 
240 aa  42  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.440152  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  30.86 
 
 
250 aa  42  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 
209 aa  42  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  35.53 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  27.78 
 
 
196 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  35.53 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  27.78 
 
 
196 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>