63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01060 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  100 
 
 		 222 aa  465  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  51.79 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  37.84 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  38.91 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  41.44 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  39.64 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  41.44 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.37 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  37.39 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  37.39 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  37.95 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  38.29 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  34.51 
 
 		 224 aa  134  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 		 222 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  32.87 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  32.87 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  34.96 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  34.2 
 
 		 236 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  32.9 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  31.74 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  33.48 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  32.17 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  32.17 
 
 		 236 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  32.17 
 
 		 288 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 235 aa  95.1  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 232 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.45 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 		 236 aa  88.2  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  29.31 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  29.18 
 
 		 250 aa  85.1  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  28.7 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  27.52 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  27.52 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  27.06 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  27.06 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  27.06 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  27.06 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  27.06 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  26.61 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  26.06 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.7 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  25.29 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  25.57 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  26.76 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  23.58 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  25.57 
 
 		 370 aa  45.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1302  Phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106982  decreased coverage  0.000409559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>