95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3217 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 224 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  94.64 
 
 		 236 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  93.3 
 
 		 224 aa  427  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  91.52 
 
 		 224 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  91.52 
 
 		 224 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  91.07 
 
 		 224 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  83.48 
 
 		 236 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  71.43 
 
 		 224 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  71.43 
 
 		 224 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  60.18 
 
 		 225 aa  249  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  42.92 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 223 aa  174  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 223 aa  174  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  43.35 
 
 		 222 aa  174  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  44 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  38.07 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40.44 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  41.74 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  41.92 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  39.57 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  40.43 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 271 aa  158  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  38.72 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  38.14 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  36 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  37.33 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  35.11 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  37.29 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  36.44 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  32.17 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 230 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  32.77 
 
 		 238 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  30.64 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  34.75 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  34.82 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  31.05 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  30.94 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  30.94 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  30.94 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  30.94 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  30.94 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  30.94 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  30.94 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  29.96 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  24.4 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  28.7 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  29.86 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1022  phosphoglycerate mutase  24.45 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  32.65 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  27.84 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1462  phosphoglyceromutase  34.04 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.68427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  26.06 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.23 
 
 		 177 aa  45.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  31.18 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  31.87 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  31.91 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  31.18 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  30 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  26.34 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 411 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  27.08 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.71 
 
 		 444 aa  43.1  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  31.87 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  22.99 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  29 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  29 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.03 
 
 		 427 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.62 
 
 		 158 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0092  phosphoglycerate mutase family protein  24.89 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2156  Phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.63 
 
 		 166 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  32.97 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 253 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1985  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  27.96 
 
 		 237 aa  42  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  26.88 
 
 		 248 aa  42  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  28.57 
 
 		 249 aa  42  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  27.08 
 
 		 207 aa  42  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  28.72 
 
 		 230 aa  41.6  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 248 aa  41.6  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.62 
 
 		 158 aa  41.6  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>