85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2201 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
229 aa  471  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  38.93 
 
 
244 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 
234 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  42.61 
 
 
223 aa  148  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 
230 aa  148  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  38.53 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  38.53 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  38.53 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  39.06 
 
 
229 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  39.06 
 
 
229 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  39.06 
 
 
229 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  39.06 
 
 
229 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  39.06 
 
 
229 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  36.71 
 
 
236 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  34.43 
 
 
244 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  34 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.82 
 
 
236 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  37.71 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.78 
 
 
236 aa  135  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  37.13 
 
 
236 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  35.17 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 
235 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 
236 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 
223 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 
223 aa  122  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  32.44 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  33.9 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 
227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 
224 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 
224 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  33.47 
 
 
236 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  36.52 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  35.65 
 
 
236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  33.47 
 
 
288 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  34.82 
 
 
236 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 
222 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.22 
 
 
224 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 
234 aa  111  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  34.82 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 
224 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 
224 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 
224 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  33.47 
 
 
220 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  35.75 
 
 
224 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  34.2 
 
 
225 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.48 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 
271 aa  95.5  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  29.46 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  27.35 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  25.11 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  26.52 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  25.33 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  28.51 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  25.97 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 
226 aa  48.5  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  24.34 
 
 
205 aa  48.5  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  24.12 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  25 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  22.77 
 
 
196 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.72 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 
220 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  27.56 
 
 
224 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  21.88 
 
 
196 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  21.88 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  22.52 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  22.07 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  21.88 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  22.07 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  22.07 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  26.26 
 
 
165 aa  43.1  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 
211 aa  42.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1270  Phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 
166 aa  43.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.05 
 
 
444 aa  42.4  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  25.78 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  24.68 
 
 
213 aa  42  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2546  Phosphoglycerate mutase  22.47 
 
 
255 aa  41.6  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>