70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4560 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  43.91 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  37.55 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  38.27 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  38.77 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.86 
 
 		 236 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  42.04 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  38.68 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  38.68 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  36.48 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  39.57 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  39.57 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  40.87 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  40.87 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  40.87 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  40.87 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  40.87 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  35.66 
 
 		 288 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  39.57 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  34.71 
 
 		 238 aa  121  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.22 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  37.22 
 
 		 223 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  37.22 
 
 		 223 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 222 aa  111  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  36.49 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  33.78 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  38.33 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  32.88 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  36.61 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  36.61 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  29.75 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  35.27 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  35.27 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  35.39 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  28.07 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  27.8 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.1 
 
 		 157 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0362  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  36 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  25.99 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2162  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.47 
 
 		 170 aa  42.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.41 
 
 		 442 aa  41.6  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>