More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0356 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0356  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 128 aa  238  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  74.4 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  71.88 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  71.88 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  58.59 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  64.06 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 		 128 aa  115  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1371  50S ribosomal protein L7/L12  64.06 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.526741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  64.29 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  63.57 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 124 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2178  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.900268  normal  0.0233119 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 		 125 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  60.94 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1888  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000229099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 		 125 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 		 122 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1548  ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 127 aa  106  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2950  ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.223203  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1783  50S ribosomal protein L7/L12  67.44 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  59.69 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 129 aa  103  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  64.29 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  58.59 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  58.59 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  62.5 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  61.29 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2037  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0646478  normal  0.703058 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  62.1 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  59.35 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  57.03 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  61.72 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 122 aa  100  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  60.16 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0450  50S ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  51.67 
 
 		 123 aa  100  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1065  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00323205  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0480  ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01080  ribosomal protein L7/L12  64.06 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  56.91 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1338  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1820  ribosomal protein L7/L12  55.38 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  48.44 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1454  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 123 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0711  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0094  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  57.72 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1635  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  45.31 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  60.53 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  58.91 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  56.25 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2343  ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00477548  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  55.2 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0866  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2675  ribosomal protein L7/L12  57.85 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000113086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0095  50S ribosomal protein L7/L12  59.38 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000523808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  56.1 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0925  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  56.8 
 
 		 123 aa  95.9  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  50 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  58.87 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  55.28 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  53.91 
 
 		 124 aa  95.1  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  50.78 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  58.06 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  55.47 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  60.16 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0597  50S ribosomal protein L7/L12  57.81 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0210666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>