More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3359 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3359  flagellin domain protein  100 
 
 
716 aa  1356    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  31.88 
 
 
494 aa  103  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  31.48 
 
 
492 aa  97.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  35.86 
 
 
498 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  35.86 
 
 
493 aa  94.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  35.86 
 
 
493 aa  94.7  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174414 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  29.9 
 
 
497 aa  92.8  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  34.91 
 
 
387 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  36.18 
 
 
388 aa  90.1  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  35.48 
 
 
383 aa  90.1  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  37.34 
 
 
388 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  37.34 
 
 
388 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  37.34 
 
 
388 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  37.34 
 
 
388 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  37.34 
 
 
388 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  37.34 
 
 
388 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  30.42 
 
 
492 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  37.34 
 
 
388 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  52.27 
 
 
462 aa  89  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  34.87 
 
 
377 aa  88.2  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  34.87 
 
 
377 aa  88.2  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  32.77 
 
 
377 aa  87.4  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  35.44 
 
 
384 aa  87.4  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  35.44 
 
 
384 aa  87.4  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0834  flagellin domain-containing protein  35.46 
 
 
399 aa  87.4  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.9933 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  36.55 
 
 
377 aa  87.4  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  34.97 
 
 
377 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  36.62 
 
 
481 aa  87  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  35.86 
 
 
377 aa  87  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  35.86 
 
 
377 aa  87  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2150  flagellin-like protein  38.17 
 
 
629 aa  86.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  32.7 
 
 
484 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  35.39 
 
 
493 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  37.24 
 
 
492 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  49.46 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  30.74 
 
 
493 aa  85.1  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  34.42 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  50 
 
 
609 aa  84.7  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  34.27 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  30.97 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  35.14 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  34.21 
 
 
378 aa  83.2  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  34.75 
 
 
377 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0223  flagellin  34.18 
 
 
389 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778808  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  33.57 
 
 
376 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  37.32 
 
 
501 aa  83.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  33.33 
 
 
272 aa  83.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  34.59 
 
 
391 aa  83.2  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  31.52 
 
 
490 aa  83.2  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  51.14 
 
 
285 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  34.44 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  36.31 
 
 
272 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0198  flagellin-like protein  34.78 
 
 
936 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  52.94 
 
 
279 aa  83.2  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  35 
 
 
483 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  34 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  40.15 
 
 
502 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  34.51 
 
 
482 aa  82  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2114  flagellin  50.59 
 
 
506 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.168497 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  38.32 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  32.43 
 
 
580 aa  81.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0670  flagellin domain protein  33.81 
 
 
780 aa  81.3  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  35.17 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  34.87 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  40.15 
 
 
506 aa  80.9  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  35.29 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  31.28 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  40.15 
 
 
506 aa  80.9  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  34.78 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  32.05 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2534  flagellin-like  31.58 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  33.11 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  40.15 
 
 
506 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  43 
 
 
505 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  32.12 
 
 
276 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0151  flagellin domain-containing protein  35.48 
 
 
516 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.382062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  33.72 
 
 
472 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  34.51 
 
 
393 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1626  flagellin domain protein  33.56 
 
 
529 aa  80.1  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  43 
 
 
505 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  44.55 
 
 
279 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  44.55 
 
 
278 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  32.24 
 
 
377 aa  79.7  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  33.1 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  33.55 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  33.55 
 
 
384 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  32.92 
 
 
467 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  37.16 
 
 
488 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  35.53 
 
 
379 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  47.73 
 
 
287 aa  79.7  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27700  Flagellin  35.76 
 
 
567 aa  79.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  43.16 
 
 
492 aa  79.3  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  32.89 
 
 
379 aa  79  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3343  flagellin  50.57 
 
 
272 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  32.61 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  34.48 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  38.73 
 
 
486 aa  78.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  34.48 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0168  flagellin domain-containing protein  33.8 
 
 
513 aa  78.2  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  47.73 
 
 
587 aa  78.2  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>