More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2150 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2150  flagellin-like protein  100 
 
 		 629 aa  1236    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  48.4 
 
 		 384 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  48.4 
 
 		 384 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5252  flagellin  47.31 
 
 		 398 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  47.64 
 
 		 580 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0223  flagellin  50.94 
 
 		 389 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  52.2 
 
 		 404 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  49.06 
 
 		 263 aa  147  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  45.56 
 
 		 505 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  45.56 
 
 		 505 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  40.08 
 
 		 373 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2114  flagellin  45.51 
 
 		 506 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.168497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  47.13 
 
 		 494 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27700  Flagellin  45.45 
 
 		 567 aa  145  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  42.65 
 
 		 395 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2698  flagellin  45.18 
 
 		 585 aa  145  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132656 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  50 
 
 		 375 aa  145  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  50.94 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  50.94 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  50.94 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  50.94 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  50.94 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  50.94 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  50.94 
 
 		 388 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  48.86 
 
 		 276 aa  144  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  46.29 
 
 		 422 aa  144  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  42.49 
 
 		 493 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1053  flagellin  46.23 
 
 		 568 aa  144  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  40 
 
 		 356 aa  144  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  42.16 
 
 		 412 aa  143  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0151  flagellin domain-containing protein  44.21 
 
 		 516 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.382062 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  47.83 
 
 		 502 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  43.48 
 
 		 369 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  43.48 
 
 		 369 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  51.32 
 
 		 490 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  47.83 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  42.5 
 
 		 475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  50.31 
 
 		 383 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  47.83 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  47.83 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  50 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  47.53 
 
 		 475 aa  142  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2158  flagellin  46.67 
 
 		 579 aa  141  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1258  flagellin  46.89 
 
 		 545 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0516151 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  47.56 
 
 		 609 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  47.67 
 
 		 501 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2022  putative flagellin  45.86 
 
 		 349 aa  140  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  49.06 
 
 		 404 aa  140  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  43.33 
 
 		 379 aa  140  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  46.88 
 
 		 266 aa  140  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  32.78 
 
 		 412 aa  140  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  43.22 
 
 		 493 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  47.8 
 
 		 263 aa  140  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  47.5 
 
 		 405 aa  140  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1723  flagellin domain protein  44.38 
 
 		 498 aa  138  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.774515  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  36.02 
 
 		 517 aa  138  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  47.8 
 
 		 388 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  40.09 
 
 		 467 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  46.54 
 
 		 263 aa  137  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  44.32 
 
 		 271 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  44.32 
 
 		 271 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  47.85 
 
 		 587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  41.63 
 
 		 484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  46.34 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  48.68 
 
 		 506 aa  135  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  41.63 
 
 		 485 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  39.57 
 
 		 392 aa  135  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  47.06 
 
 		 283 aa  135  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  35.46 
 
 		 488 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  47.53 
 
 		 492 aa  134  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  43.84 
 
 		 462 aa  134  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  44.25 
 
 		 271 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0103  flagellin  51.57 
 
 		 381 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  48 
 
 		 288 aa  134  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  40.09 
 
 		 468 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  44.25 
 
 		 271 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  45.4 
 
 		 272 aa  133  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  47.2 
 
 		 471 aa  133  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  42.41 
 
 		 272 aa  133  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  35.63 
 
 		 516 aa  133  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  47.83 
 
 		 262 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2023  flagellin  47.47 
 
 		 160 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3832  flagellin  51.57 
 
 		 381 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  44.57 
 
 		 282 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  43.71 
 
 		 271 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  47.77 
 
 		 472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  43.71 
 
 		 271 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  45.11 
 
 		 294 aa  132  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  43.1 
 
 		 272 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  42.13 
 
 		 319 aa  131  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  43.1 
 
 		 272 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  47.88 
 
 		 280 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  47.5 
 
 		 488 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  45.91 
 
 		 437 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  41.88 
 
 		 272 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  42.78 
 
 		 271 aa  130  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  40.48 
 
 		 387 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  41.24 
 
 		 492 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  42.05 
 
 		 393 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  39.29 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>