More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0176 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.29 
 
 		 470 aa  636    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.18 
 
 		 464 aa  643    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.29 
 
 		 470 aa  638    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0176  ATP synthase F1, beta subunit  100 
 
 		 481 aa  975    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.792226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  65.89 
 
 		 471 aa  640    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  67.73 
 
 		 470 aa  672    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 		 467 aa  653    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.86 
 
 		 475 aa  656    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.29 
 
 		 470 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.25 
 
 		 462 aa  638    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  66.67 
 
 		 467 aa  640    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.71 
 
 		 471 aa  637    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.92 
 
 		 471 aa  637    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.66 
 
 		 471 aa  632  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.97 
 
 		 465 aa  634  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.33 
 
 		 473 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.96 
 
 		 468 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.05 
 
 		 482 aa  630  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  62.24 
 
 		 487 aa  629  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.96 
 
 		 468 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.79 
 
 		 472 aa  629  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.66 
 
 		 470 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.54 
 
 		 473 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.66 
 
 		 470 aa  629  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.53 
 
 		 468 aa  625  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.03 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.03 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.03 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.98 
 
 		 472 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.03 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  63.05 
 
 		 482 aa  627  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.5 
 
 		 474 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 464 aa  624  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.76 
 
 		 468 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.76 
 
 		 468 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.53 
 
 		 468 aa  624  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  64.39 
 
 		 464 aa  622  1e-177  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.18 
 
 		 481 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.97 
 
 		 462 aa  618  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.88 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.39 
 
 		 469 aa  620  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.97 
 
 		 482 aa  619  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.18 
 
 		 462 aa  617  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.42 
 
 		 493 aa  618  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.68 
 
 		 472 aa  619  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.69 
 
 		 484 aa  619  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.35 
 
 		 476 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5090  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.24 
 
 		 482 aa  618  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.41 
 
 		 471 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.03 
 
 		 465 aa  619  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0564  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.5 
 
 		 464 aa  617  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.257197  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.9 
 
 		 465 aa  615  1e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.97 
 
 		 462 aa  616  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.19 
 
 		 471 aa  615  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.35 
 
 		 476 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.92 
 
 		 476 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.14 
 
 		 476 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.82 
 
 		 465 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_503  ATP synthase F1, beta subunit  62.34 
 
 		 464 aa  616  1e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0039983  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.45 
 
 		 467 aa  617  1e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.47 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4176  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.11 
 
 		 460 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0938283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4503  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.93 
 
 		 482 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4202  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.11 
 
 		 460 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16362  normal  0.223697 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.47 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.37 
 
 		 483 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.5 
 
 		 476 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.33 
 
 		 462 aa  612  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4226  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.11 
 
 		 460 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  64.26 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.37 
 
 		 483 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0538  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.34 
 
 		 464 aa  612  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.120643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.13 
 
 		 475 aa  613  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4484  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.93 
 
 		 482 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.64 
 
 		 466 aa  614  9.999999999999999e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.18 
 
 		 462 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.08 
 
 		 465 aa  610  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.22 
 
 		 471 aa  609  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.73 
 
 		 480 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0008  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.9 
 
 		 460 aa  609  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.366806  normal  0.022382 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.01 
 
 		 503 aa  608  1e-173  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.72 
 
 		 482 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.47 
 
 		 484 aa  609  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.33 
 
 		 457 aa  611  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.11 
 
 		 462 aa  610  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  63.06 
 
 		 470 aa  608  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.91 
 
 		 468 aa  608  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2407  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.19 
 
 		 480 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.164564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6062  ATP synthase F1, beta subunit  61.83 
 
 		 481 aa  607  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5018  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.47 
 
 		 485 aa  604  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.03 
 
 		 474 aa  604  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.81 
 
 		 468 aa  605  9.999999999999999e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.83 
 
 		 465 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.68 
 
 		 473 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.47 
 
 		 484 aa  607  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.83 
 
 		 465 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.92 
 
 		 476 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  62.47 
 
 		 460 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5168  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.47 
 
 		 460 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.05631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>