62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3284 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3284  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  862    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320918  normal  0.738751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1425  hypothetical protein  51.9 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1264  hypothetical protein  52.14 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  0.593096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1214  hypothetical protein  50.47 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.213973  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3329  hypothetical protein  49.88 
 
 		 429 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4849  hypothetical protein  48.14 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002432  predicted membrane protein  47.47 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0508  hypothetical protein  46.6 
 
 		 437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1905  membrane protein  38.72 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1931  membrane protein  38.24 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2388  hypothetical protein  38.24 
 
 		 429 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1938  membrane protein  38.48 
 
 		 421 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1348  hypothetical protein  40.1 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2825  membrane protein-like protein  39.51 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02018  predicted membrane protein  34.53 
 
 		 435 aa  263  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0016  hypothetical protein  39.61 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1190  membrane protein  39.12 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2274  hypothetical protein  38.44 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.433332  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2342  hypothetical protein  40.94 
 
 		 411 aa  244  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0185425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2990  cellulose binding, type IV  36.46 
 
 		 414 aa  239  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.99957  hitchhiker  0.00000012817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1877  hypothetical protein  36.53 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.706063  normal  0.740241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2389  hypothetical protein  28.92 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1901  hypothetical protein  27.13 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000424088 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0468  hypothetical protein  28.29 
 
 		 442 aa  106  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3822  hypothetical protein  28.29 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1904  N-6 Adenine-specific DNA methylase  25.86 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.919082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1020  hypothetical protein  26.19 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1341  hypothetical protein  23.06 
 
 		 448 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0986  hypothetical protein  26.4 
 
 		 468 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0392  hypothetical protein  27.34 
 
 		 452 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2732  hypothetical protein  27.98 
 
 		 454 aa  89.7  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4135  hypothetical protein  24.43 
 
 		 451 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.938574  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3825  Protein of unknown function DUF2254, membrane  28.12 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6041  hypothetical protein  24.63 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3522  hypothetical protein  26.6 
 
 		 452 aa  87.8  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00487246  normal  0.144649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3748  hypothetical protein  26.15 
 
 		 432 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45143  predicted protein  26.21 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537975  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0535  hypothetical protein  27.97 
 
 		 540 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.034175 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1733  hypothetical protein  28.31 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2677  hypothetical protein  27.78 
 
 		 441 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11316  hypothetical protein  26.3 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.792444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2648  hypothetical protein  27.78 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2693  hypothetical protein  27.78 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0705216  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4587  hypothetical protein  27.46 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0145917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5129  hypothetical protein  29.64 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0547  hypothetical protein  26.99 
 
 		 559 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2678  hypothetical protein  25.26 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397076  normal  0.0401101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3348  formate C-acetyltransferase glycine radical  26.69 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.724632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3804  hypothetical protein  28.8 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0953  hypothetical protein  25.7 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.206093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2028  N-6 adenine-specific DNA methylase  24.5 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1980  hypothetical protein  26.44 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.258182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2428  membrane protein-like  25.74 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4215  hypothetical protein  25.53 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1106  hypothetical protein  24.11 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2932  hypothetical protein  24.21 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0142508  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1106  hypothetical protein  24.19 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1379  membrane protein-like protein  25.39 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0469638  normal  0.415968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3134  hypothetical protein  23.42 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142583  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06095  hypothetical protein  20.49 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0898  hypothetical protein  24.63 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2628  membrane protein-like protein  34.62 
 
 		 125 aa  50.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000115122  hitchhiker  0.00240187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>