63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2693 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2693  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  890    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0705216  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2648  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  890    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2677  hypothetical protein  99.77 
 
 
441 aa  871    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385081  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0986  hypothetical protein  57.01 
 
 
468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3804  hypothetical protein  57.21 
 
 
466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0392  hypothetical protein  51.28 
 
 
452 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3522  hypothetical protein  50.8 
 
 
452 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00487246  normal  0.144649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1733  hypothetical protein  48.04 
 
 
451 aa  322  9.000000000000001e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3825  Protein of unknown function DUF2254, membrane  43.65 
 
 
452 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3822  hypothetical protein  37.93 
 
 
434 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1901  hypothetical protein  30.58 
 
 
442 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000424088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11316  hypothetical protein  33.41 
 
 
521 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.792444  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1980  hypothetical protein  34.24 
 
 
447 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.258182  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2678  hypothetical protein  33.18 
 
 
448 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397076  normal  0.0401101 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0953  hypothetical protein  34.04 
 
 
459 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.206093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0468  hypothetical protein  33.16 
 
 
442 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2732  hypothetical protein  32.38 
 
 
454 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4135  hypothetical protein  30.16 
 
 
451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.938574  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1904  N-6 Adenine-specific DNA methylase  33.59 
 
 
445 aa  169  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.919082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2389  hypothetical protein  30.92 
 
 
444 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3748  hypothetical protein  40.62 
 
 
432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1020  hypothetical protein  33.16 
 
 
435 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4215  hypothetical protein  30.53 
 
 
443 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45143  predicted protein  28.15 
 
 
457 aa  159  7e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537975  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6041  hypothetical protein  41.11 
 
 
430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753451  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1341  hypothetical protein  28.22 
 
 
448 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3348  formate C-acetyltransferase glycine radical  35.61 
 
 
429 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.724632  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2028  N-6 adenine-specific DNA methylase  30.58 
 
 
431 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5129  hypothetical protein  30.75 
 
 
487 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4587  hypothetical protein  29.76 
 
 
465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0145917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2428  membrane protein-like  29.21 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0535  hypothetical protein  28.82 
 
 
540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.034175 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0547  hypothetical protein  27.91 
 
 
559 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1379  membrane protein-like protein  30.46 
 
 
442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0469638  normal  0.415968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0898  hypothetical protein  31.15 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3134  hypothetical protein  28.85 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142583  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2932  hypothetical protein  29.9 
 
 
421 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0142508  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06095  hypothetical protein  23.99 
 
 
429 aa  106  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2628  membrane protein-like protein  56.57 
 
 
125 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000115122  hitchhiker  0.00240187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3329  hypothetical protein  28.3 
 
 
429 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1106  hypothetical protein  24.52 
 
 
432 aa  95.1  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1106  hypothetical protein  23.56 
 
 
432 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1425  hypothetical protein  29.43 
 
 
429 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1264  hypothetical protein  30.04 
 
 
429 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  0.593096 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2274  hypothetical protein  27.4 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.433332  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1214  hypothetical protein  26.58 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.213973  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3284  hypothetical protein  27.78 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320918  normal  0.738751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0508  hypothetical protein  26.57 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148293  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002432  predicted membrane protein  25.55 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268557  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2825  membrane protein-like protein  29.04 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1905  membrane protein  22.71 
 
 
429 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1348  hypothetical protein  26.35 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4849  hypothetical protein  25.93 
 
 
425 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0016  hypothetical protein  27.19 
 
 
429 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1931  membrane protein  22.22 
 
 
429 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2388  hypothetical protein  23.27 
 
 
429 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1938  membrane protein  23.27 
 
 
421 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2990  cellulose binding, type IV  24.28 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.99957  hitchhiker  0.00000012817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2342  hypothetical protein  27.04 
 
 
411 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0185425  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02018  predicted membrane protein  21.85 
 
 
435 aa  60.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1190  membrane protein  24.39 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1877  hypothetical protein  27.31 
 
 
424 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.706063  normal  0.740241 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2214  hypothetical protein  28.03 
 
 
425 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>