63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3804 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3804  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  913    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0986  hypothetical protein  73.28 
 
 
468 aa  663    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2648  hypothetical protein  57.21 
 
 
451 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2693  hypothetical protein  57.21 
 
 
451 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0705216  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2677  hypothetical protein  57.8 
 
 
441 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385081  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3522  hypothetical protein  55.53 
 
 
452 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00487246  normal  0.144649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0392  hypothetical protein  53.27 
 
 
452 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1733  hypothetical protein  49.53 
 
 
451 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3825  Protein of unknown function DUF2254, membrane  44.01 
 
 
452 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1980  hypothetical protein  36.56 
 
 
447 aa  217  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.258182  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0953  hypothetical protein  33.26 
 
 
459 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.206093  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2678  hypothetical protein  31.18 
 
 
448 aa  193  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397076  normal  0.0401101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1901  hypothetical protein  29.38 
 
 
442 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000424088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11316  hypothetical protein  34.34 
 
 
521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.792444  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2732  hypothetical protein  32.14 
 
 
454 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3822  hypothetical protein  36.62 
 
 
434 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1020  hypothetical protein  35.58 
 
 
435 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4135  hypothetical protein  30.22 
 
 
451 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.938574  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0468  hypothetical protein  32.37 
 
 
442 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3348  formate C-acetyltransferase glycine radical  37.57 
 
 
429 aa  169  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.724632  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6041  hypothetical protein  36.48 
 
 
430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753451  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45143  predicted protein  28.04 
 
 
457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537975  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3748  hypothetical protein  34.52 
 
 
432 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4215  hypothetical protein  32.75 
 
 
443 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2028  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.86 
 
 
431 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0535  hypothetical protein  27.16 
 
 
540 aa  159  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.034175 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0547  hypothetical protein  26.77 
 
 
559 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5129  hypothetical protein  29.8 
 
 
487 aa  156  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1904  N-6 Adenine-specific DNA methylase  30.46 
 
 
445 aa  156  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.919082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2389  hypothetical protein  29.43 
 
 
444 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1341  hypothetical protein  25.3 
 
 
448 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4587  hypothetical protein  31.22 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0145917 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2932  hypothetical protein  28.72 
 
 
421 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0142508  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2428  membrane protein-like  26.71 
 
 
438 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3134  hypothetical protein  29.29 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142583  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0898  hypothetical protein  32.62 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06095  hypothetical protein  23.51 
 
 
429 aa  110  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2628  membrane protein-like protein  56.7 
 
 
125 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000115122  hitchhiker  0.00240187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1379  membrane protein-like protein  27.62 
 
 
442 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0469638  normal  0.415968 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2274  hypothetical protein  29.08 
 
 
394 aa  95.5  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.433332  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1264  hypothetical protein  28.09 
 
 
429 aa  94  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  0.593096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3329  hypothetical protein  27.1 
 
 
429 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1425  hypothetical protein  28.09 
 
 
429 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1214  hypothetical protein  28.12 
 
 
443 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.213973  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3284  hypothetical protein  28.62 
 
 
431 aa  86.7  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320918  normal  0.738751 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2342  hypothetical protein  29.89 
 
 
411 aa  86.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0185425  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1106  hypothetical protein  22.86 
 
 
432 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1106  hypothetical protein  21.54 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002432  predicted membrane protein  24.44 
 
 
422 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0508  hypothetical protein  26.69 
 
 
437 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148293  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1348  hypothetical protein  26.79 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1877  hypothetical protein  28.47 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.706063  normal  0.740241 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1190  membrane protein  24.14 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0016  hypothetical protein  27.3 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1905  membrane protein  25.91 
 
 
429 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1938  membrane protein  25.45 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2388  hypothetical protein  24.7 
 
 
429 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4849  hypothetical protein  24.38 
 
 
425 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1931  membrane protein  25.3 
 
 
429 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2825  membrane protein-like protein  24.92 
 
 
426 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2990  cellulose binding, type IV  24.36 
 
 
414 aa  60.1  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.99957  hitchhiker  0.00000012817 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02018  predicted membrane protein  19.43 
 
 
435 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1490  hypothetical protein  22.28 
 
 
546 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665222  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>