64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2389 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2389  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  897    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1901  hypothetical protein  40.36 
 
 
442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000424088 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0953  hypothetical protein  36.92 
 
 
459 aa  265  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.206093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0468  hypothetical protein  37.32 
 
 
442 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2732  hypothetical protein  34.26 
 
 
454 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3822  hypothetical protein  33.97 
 
 
434 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1904  N-6 Adenine-specific DNA methylase  37.5 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.919082 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2678  hypothetical protein  34.02 
 
 
448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397076  normal  0.0401101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4215  hypothetical protein  33.41 
 
 
443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4135  hypothetical protein  34.06 
 
 
451 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.938574  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45143  predicted protein  31.54 
 
 
457 aa  213  5.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1341  hypothetical protein  31.49 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000193144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4587  hypothetical protein  32.64 
 
 
465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0145917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5129  hypothetical protein  33.03 
 
 
487 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11316  hypothetical protein  33.41 
 
 
521 aa  190  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.792444  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3748  hypothetical protein  31.41 
 
 
432 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3348  formate C-acetyltransferase glycine radical  30.37 
 
 
429 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.724632  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2028  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.51 
 
 
431 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6041  hypothetical protein  31.19 
 
 
430 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753451  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0535  hypothetical protein  29.96 
 
 
540 aa  183  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.034175 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0392  hypothetical protein  33.8 
 
 
452 aa  180  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0547  hypothetical protein  28.76 
 
 
559 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3522  hypothetical protein  32.72 
 
 
452 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00487246  normal  0.144649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3825  Protein of unknown function DUF2254, membrane  31.78 
 
 
452 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2677  hypothetical protein  31.33 
 
 
441 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385081  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2693  hypothetical protein  31.33 
 
 
451 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0705216  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2648  hypothetical protein  31.33 
 
 
451 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1980  hypothetical protein  31.44 
 
 
447 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.258182  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1020  hypothetical protein  29.95 
 
 
435 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1733  hypothetical protein  30.65 
 
 
451 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0986  hypothetical protein  29.34 
 
 
468 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3804  hypothetical protein  29.9 
 
 
466 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06095  hypothetical protein  25.3 
 
 
429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2428  membrane protein-like  28.87 
 
 
438 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3284  hypothetical protein  29.34 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320918  normal  0.738751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3134  hypothetical protein  26.68 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142583  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3329  hypothetical protein  30.89 
 
 
429 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1106  hypothetical protein  25.22 
 
 
432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1106  hypothetical protein  25.22 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1379  membrane protein-like protein  27.9 
 
 
442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0469638  normal  0.415968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0898  hypothetical protein  30.53 
 
 
432 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002432  predicted membrane protein  28.35 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268557  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1905  membrane protein  27.96 
 
 
429 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1931  membrane protein  27.96 
 
 
429 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4849  hypothetical protein  29.85 
 
 
425 aa  107  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2388  hypothetical protein  27.46 
 
 
429 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1938  membrane protein  29.11 
 
 
421 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02018  predicted membrane protein  27.3 
 
 
435 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0508  hypothetical protein  29.2 
 
 
437 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148293  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2932  hypothetical protein  26.75 
 
 
421 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0142508  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2990  cellulose binding, type IV  29.39 
 
 
414 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.99957  hitchhiker  0.00000012817 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2274  hypothetical protein  27.27 
 
 
394 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.433332  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1348  hypothetical protein  26.08 
 
 
429 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0016  hypothetical protein  25.81 
 
 
429 aa  96.3  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1214  hypothetical protein  28.61 
 
 
443 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.213973  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1264  hypothetical protein  26.81 
 
 
429 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  0.593096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1425  hypothetical protein  26.81 
 
 
429 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2342  hypothetical protein  26.95 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0185425  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1877  hypothetical protein  28.46 
 
 
424 aa  76.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.706063  normal  0.740241 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2825  membrane protein-like protein  24.13 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1190  membrane protein  23.92 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2628  membrane protein-like protein  43.84 
 
 
125 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000115122  hitchhiker  0.00240187 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1679  hypothetical protein  26.02 
 
 
518 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0944  hypothetical protein  26.83 
 
 
522 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>