48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2628 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2628  membrane protein-like protein  100 
 
 		 125 aa  244  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000115122  hitchhiker  0.00240187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0392  hypothetical protein  64.29 
 
 		 452 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3522  hypothetical protein  67.01 
 
 		 452 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00487246  normal  0.144649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2693  hypothetical protein  56.57 
 
 		 451 aa  103  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0705216  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2648  hypothetical protein  56.57 
 
 		 451 aa  103  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2677  hypothetical protein  56.57 
 
 		 441 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0986  hypothetical protein  58.76 
 
 		 468 aa  103  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3804  hypothetical protein  56.7 
 
 		 466 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1733  hypothetical protein  58.16 
 
 		 451 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3825  Protein of unknown function DUF2254, membrane  46.15 
 
 		 452 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1980  hypothetical protein  40.59 
 
 		 447 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.258182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1901  hypothetical protein  43.96 
 
 		 442 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000424088 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0547  hypothetical protein  39.36 
 
 		 559 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0953  hypothetical protein  46.34 
 
 		 459 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.206093  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3822  hypothetical protein  43.43 
 
 		 434 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0535  hypothetical protein  39.56 
 
 		 540 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.034175 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0468  hypothetical protein  44.16 
 
 		 442 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2678  hypothetical protein  39.8 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397076  normal  0.0401101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1341  hypothetical protein  37.76 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1020  hypothetical protein  41.77 
 
 		 435 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1106  hypothetical protein  35.48 
 
 		 432 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1106  hypothetical protein  35.48 
 
 		 432 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4587  hypothetical protein  42.31 
 
 		 465 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0145917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4215  hypothetical protein  39.47 
 
 		 443 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2389  hypothetical protein  43.84 
 
 		 444 aa  57.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5129  hypothetical protein  41.43 
 
 		 487 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3348  formate C-acetyltransferase glycine radical  41.67 
 
 		 429 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.724632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3748  hypothetical protein  40.74 
 
 		 432 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1904  N-6 Adenine-specific DNA methylase  40.51 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.919082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2028  N-6 adenine-specific DNA methylase  34.78 
 
 		 431 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06095  hypothetical protein  36.84 
 
 		 429 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4135  hypothetical protein  46.38 
 
 		 451 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.938574  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6041  hypothetical protein  41.03 
 
 		 430 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2732  hypothetical protein  45.59 
 
 		 454 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3284  hypothetical protein  34.18 
 
 		 431 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320918  normal  0.738751 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45143  predicted protein  36.84 
 
 		 457 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537975  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11316  hypothetical protein  47.06 
 
 		 521 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.792444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3329  hypothetical protein  38.24 
 
 		 429 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1214  hypothetical protein  36.92 
 
 		 443 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.213973  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1264  hypothetical protein  35.38 
 
 		 429 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  0.593096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1425  hypothetical protein  35.38 
 
 		 429 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4849  hypothetical protein  34.33 
 
 		 425 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1379  membrane protein-like protein  39.66 
 
 		 442 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0469638  normal  0.415968 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002432  predicted membrane protein  32.88 
 
 		 422 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268557  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0016  hypothetical protein  29.41 
 
 		 429 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1348  hypothetical protein  29.41 
 
 		 429 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0898  hypothetical protein  32.58 
 
 		 432 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2825  membrane protein-like protein  27.94 
 
 		 426 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>