61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1190 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1190  membrane protein  100 
 
 		 419 aa  833    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1905  membrane protein  55.37 
 
 		 429 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1938  membrane protein  55.37 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2388  hypothetical protein  55.61 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1931  membrane protein  54.89 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02018  predicted membrane protein  45.58 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1264  hypothetical protein  43.48 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.937612  normal  0.593096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1425  hypothetical protein  43 
 
 		 429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3284  hypothetical protein  39.12 
 
 		 431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320918  normal  0.738751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1214  hypothetical protein  42.57 
 
 		 443 aa  277  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.213973  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3329  hypothetical protein  39.11 
 
 		 429 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002432  predicted membrane protein  39.84 
 
 		 422 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0508  hypothetical protein  39.61 
 
 		 437 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4849  hypothetical protein  36.05 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1348  hypothetical protein  38.3 
 
 		 429 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0016  hypothetical protein  37.68 
 
 		 429 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2825  membrane protein-like protein  37.11 
 
 		 426 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261788 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2990  cellulose binding, type IV  32.11 
 
 		 414 aa  219  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.99957  hitchhiker  0.00000012817 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2274  hypothetical protein  34.02 
 
 		 394 aa  202  9e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.433332  normal  0.375315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2342  hypothetical protein  36.17 
 
 		 411 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0185425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1877  hypothetical protein  32 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.706063  normal  0.740241 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1904  N-6 Adenine-specific DNA methylase  28.94 
 
 		 445 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.919082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3822  hypothetical protein  26.7 
 
 		 434 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0468  hypothetical protein  26.38 
 
 		 442 aa  100  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2028  N-6 adenine-specific DNA methylase  27.3 
 
 		 431 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1341  hypothetical protein  25.47 
 
 		 448 aa  90.1  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000193144 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06095  hypothetical protein  22.28 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6041  hypothetical protein  27.23 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.753451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1020  hypothetical protein  24.83 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4135  hypothetical protein  25.83 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.938574  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3748  hypothetical protein  25.59 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3825  Protein of unknown function DUF2254, membrane  24.06 
 
 		 452 aa  82.8  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5129  hypothetical protein  28.64 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2389  hypothetical protein  25.36 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3804  hypothetical protein  24.02 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2428  membrane protein-like  24.02 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45143  predicted protein  24.82 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537975  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1901  hypothetical protein  26.36 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000424088 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2678  hypothetical protein  23.5 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397076  normal  0.0401101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0392  hypothetical protein  26.32 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3348  formate C-acetyltransferase glycine radical  24.88 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.724632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2677  hypothetical protein  25.15 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4587  hypothetical protein  26.65 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0145917 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2693  hypothetical protein  25.23 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0705216  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2648  hypothetical protein  25.23 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3522  hypothetical protein  24.62 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00487246  normal  0.144649 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1106  hypothetical protein  24.23 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1980  hypothetical protein  23.58 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.258182  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1106  hypothetical protein  22.07 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0986  hypothetical protein  23.27 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4215  hypothetical protein  24.71 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11316  hypothetical protein  24.28 
 
 		 521 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.792444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0953  hypothetical protein  24.09 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.206093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3134  hypothetical protein  25.25 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142583  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1733  hypothetical protein  32.2 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1379  membrane protein-like protein  23.84 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0469638  normal  0.415968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2932  hypothetical protein  25.32 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0142508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0535  hypothetical protein  21.88 
 
 		 540 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.034175 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0547  hypothetical protein  22.06 
 
 		 559 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0898  hypothetical protein  35.95 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2732  hypothetical protein  24.48 
 
 		 454 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>